More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1430 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  100 
 
 
140 aa  274  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1420  thioredoxin  74.63 
 
 
157 aa  189  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.669095  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  63.24 
 
 
150 aa  186  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  65.67 
 
 
150 aa  185  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  60.74 
 
 
160 aa  179  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  62.69 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  61.48 
 
 
144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4027  thioredoxin  60.71 
 
 
148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0913338  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  57.04 
 
 
149 aa  159  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  48.57 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  49.28 
 
 
141 aa  127  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  47.06 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  42.55 
 
 
165 aa  120  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  48.2 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  47.48 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  45.59 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  48.2 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  39.42 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  38.06 
 
 
170 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  37.96 
 
 
140 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  38.06 
 
 
170 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  38.06 
 
 
170 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  38.06 
 
 
170 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  38.06 
 
 
144 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  38.06 
 
 
144 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  39.01 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  34.78 
 
 
148 aa  110  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  38.97 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  40.71 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  38.24 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  41.3 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  43.4 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  36.03 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  37.04 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  37.96 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  41.3 
 
 
139 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  37.23 
 
 
140 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  45 
 
 
106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  34.56 
 
 
178 aa  107  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  41.51 
 
 
110 aa  107  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  40.58 
 
 
140 aa  107  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  38.57 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  40.3 
 
 
142 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  37.86 
 
 
146 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  38.06 
 
 
139 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  46.46 
 
 
107 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  47.12 
 
 
108 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0335  thioredoxin domain-containing protein  38.41 
 
 
150 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  39.13 
 
 
159 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  38.52 
 
 
146 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  45.45 
 
 
108 aa  105  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  41.43 
 
 
150 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  47.37 
 
 
106 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  46 
 
 
107 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  35.29 
 
 
146 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  38.41 
 
 
145 aa  104  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  37.23 
 
 
145 aa  103  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  37.23 
 
 
145 aa  103  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  46.46 
 
 
106 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  46.46 
 
 
106 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  31.43 
 
 
140 aa  102  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  38.85 
 
 
162 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  45.45 
 
 
106 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  37.23 
 
 
145 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  47.57 
 
 
113 aa  102  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  45.45 
 
 
106 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  39.13 
 
 
145 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  44.44 
 
 
107 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  43.43 
 
 
107 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  36.96 
 
 
141 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  43.14 
 
 
107 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  39.72 
 
 
149 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  38.13 
 
 
144 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  45.63 
 
 
105 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  46.67 
 
 
109 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  39.71 
 
 
145 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  43.43 
 
 
106 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  43.43 
 
 
119 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  45.45 
 
 
107 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3727  Thioredoxin domain  38.06 
 
 
156 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  43.43 
 
 
106 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  46.67 
 
 
108 aa  101  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  44.23 
 
 
108 aa  101  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  47.62 
 
 
109 aa  101  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  47.12 
 
 
120 aa  101  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  47.47 
 
 
106 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  35.97 
 
 
144 aa  100  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  42.31 
 
 
107 aa  100  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  37.04 
 
 
146 aa  100  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  38.03 
 
 
145 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  46.32 
 
 
106 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  46.15 
 
 
108 aa  100  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  44.23 
 
 
108 aa  100  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  43.43 
 
 
107 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  43.43 
 
 
107 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  43.43 
 
 
107 aa  100  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  43.43 
 
 
107 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  43.43 
 
 
107 aa  100  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  42.72 
 
 
106 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  35.04 
 
 
139 aa  100  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>