More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4027 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4027  thioredoxin  100 
 
 		 148 aa  298  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0913338  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  60.14 
 
 		 150 aa  189  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  57.97 
 
 		 160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  56.43 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  56.34 
 
 		 144 aa  173  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  52.74 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  60.71 
 
 		 140 aa  163  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  49.66 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1420  thioredoxin  56.12 
 
 		 157 aa  157  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.669095  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  49.29 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  46.21 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  45.8 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  43.28 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  42.14 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  36.62 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  36.62 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  41.13 
 
 		 145 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  40.69 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  40.74 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  43.48 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  46 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  44.36 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  44.23 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  39.44 
 
 		 165 aa  107  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  41.18 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  38.41 
 
 		 141 aa  107  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  42.65 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  46.08 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  36.88 
 
 		 146 aa  105  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  39.29 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  38.24 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  43.88 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  33.82 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1389  thioredoxin domain-containing protein  39.72 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.276518  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  43.27 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  40.38 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  39.73 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  43.27 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  40.44 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  41.91 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  39.16 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  39.66 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  44 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  48.24 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  42.31 
 
 		 106 aa  103  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  43.27 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  35.71 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  47.13 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  48.48 
 
 		 106 aa  103  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  41.18 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  40.14 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  40.15 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  46.46 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  40.74 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  43 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  40.2 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  47.47 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  38.69 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  43 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  47.47 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  46.32 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  44.76 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  33.81 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  43.14 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  46.51 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  43 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  39.44 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  41.84 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  39.57 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  33.58 
 
 		 170 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  42.42 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  33.58 
 
 		 170 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  33.58 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  44.21 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  31.21 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  33.58 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  33.58 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3742  thioredoxin  42.47 
 
 		 147 aa  100  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  44.23 
 
 		 120 aa  100  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  38.46 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  46.46 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  44.23 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1543  Thioredoxin domain protein  36.88 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  38.03 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  43 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  33.58 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  33.58 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3727  Thioredoxin domain  37.04 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  38.89 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  43.14 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  35.97 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  44 
 
 		 272 aa  99.4  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  37.31 
 
 		 146 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  43.68 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  37.78 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  34.06 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  34.31 
 
 		 140 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  39.71 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  40.95 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>