More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1543 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1543  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0189  Thioredoxin domain  63.31 
 
 		 147 aa  192  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0335  thioredoxin domain-containing protein  60 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3446  thioredoxin family protein, selenocysteine-containing  56.52 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238909  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  35.29 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  38.24 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1389  thioredoxin domain-containing protein  37.96 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.276518  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  32.62 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  32.62 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  34.03 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  32.64 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  33.83 
 
 		 146 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  37.5 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  33.79 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4027  thioredoxin  36.88 
 
 		 148 aa  94.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0913338  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  34.07 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  35.71 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2259  thioredoxin  32.39 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  33.57 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  34.27 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  34.56 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  35.25 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  32.84 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  34.56 
 
 		 160 aa  90.9  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  33.82 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  32.09 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0054  thioredoxin, putative  31.39 
 
 		 142 aa  90.1  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  31.72 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  33.82 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  33.82 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4096  thioredoxin domain-containing protein  33.82 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.461798  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  38.83 
 
 		 259 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  33.82 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  30.37 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  30.77 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  30.94 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  31.47 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  33.59 
 
 		 150 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  30.77 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  34.78 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  33.59 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  31.11 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  36.03 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  33.59 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  33.09 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  33.09 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  32.62 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  31.21 
 
 		 150 aa  84.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  30.83 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  32.12 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  32.87 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  30.07 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  32.61 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  29.5 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  39.56 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  32.86 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  33.09 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  31.72 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  33.09 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  28.26 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  33.09 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  28.99 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  33.09 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  33.09 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  30 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  31.88 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  34.95 
 
 		 257 aa  81.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  30.08 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  29.93 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  31.62 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  31.62 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  31.62 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  31.62 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  31.62 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  31.62 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  31.62 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  31.62 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  31.62 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  43.18 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  38.54 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  37.11 
 
 		 271 aa  80.1  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  29.93 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1420  thioredoxin  32.61 
 
 		 157 aa  80.1  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.669095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  29.93 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  37.63 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  28.57 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  33.87 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  29.63 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  37 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2375  thioredoxin-related  31.16 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.316536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  31.11 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  29.93 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  29.93 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  29.79 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  30.3 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  30.15 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2478  thioredoxin domain-containing protein  32.09 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  31.78 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3451  thioredoxin  31.65 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.560369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  35.85 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>