More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3446 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3446  thioredoxin family protein, selenocysteine-containing  100 
 
 		 150 aa  297  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0335  thioredoxin domain-containing protein  66.67 
 
 		 150 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0189  Thioredoxin domain  63.57 
 
 		 147 aa  190  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1543  Thioredoxin domain protein  56.52 
 
 		 148 aa  164  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  42.31 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  42.31 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  44.78 
 
 		 145 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  44.78 
 
 		 145 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  40.14 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  42.66 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  39.31 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  39.58 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  40.88 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  43.18 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  46.46 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  36.11 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  39.01 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  40.15 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  36.43 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  37.31 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  36.69 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  40.16 
 
 		 139 aa  100  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  36.96 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  36.96 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  36.96 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  39.86 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  36.69 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  40 
 
 		 160 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  35.71 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  36.96 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  36.96 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  37.06 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  37.04 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  36.24 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  37.98 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  37.04 
 
 		 170 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  37.04 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  35.51 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  35.51 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  35.51 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  40.54 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  35.51 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  35.51 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  35.51 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  35.51 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  35.51 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  35.71 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  35.51 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  37.86 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  35.82 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  38.62 
 
 		 141 aa  97.4  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  36.57 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  35.97 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  45.22 
 
 		 259 aa  97.4  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  36.76 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  37.8 
 
 		 139 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  36.57 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  36.81 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  39.37 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  38.58 
 
 		 139 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  37.31 
 
 		 140 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  33.1 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  36.3 
 
 		 170 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  36.3 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  41.9 
 
 		 113 aa  96.7  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  39.01 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  36.88 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  33.81 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  37.01 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  38.19 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  47.42 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  35.66 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  40 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  43.56 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  43.69 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  43.69 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  43.56 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  31.69 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  43.56 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  43.56 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  35.92 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  44.66 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  38.61 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4096  thioredoxin domain-containing protein  33.57 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.461798  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  35 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  38.89 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  43.4 
 
 		 125 aa  93.6  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  44.12 
 
 		 107 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  44.57 
 
 		 108 aa  93.2  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  43.56 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  37.01 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1389  thioredoxin domain-containing protein  35.71 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.276518  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  35.21 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  44 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  38.58 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  33.86 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  37.01 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  37.01 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  35.71 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  34.78 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>