More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_10788 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_10788  predicted protein  100 
 
 		 117 aa  239  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  51.09 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  51.09 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  46.59 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  41.9 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  40.74 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2259  thioredoxin  45.16 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  47.31 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  39.29 
 
 		 142 aa  95.9  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  37.96 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  39.25 
 
 		 147 aa  94.7  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  46.59 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  45.56 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0589  thioredoxin  40.95 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  39.42 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  39.42 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  41.18 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  42.39 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  43.53 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  41.49 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  44.09 
 
 		 104 aa  90.9  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  36.63 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  39.42 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  41.82 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  38.46 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  35.85 
 
 		 146 aa  90.1  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  45.45 
 
 		 141 aa  90.1  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  36.19 
 
 		 109 aa  90.1  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  40 
 
 		 145 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  45.24 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  42.53 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  43.68 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  41.86 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  37.25 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  43.68 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  42 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  37.25 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33356  thioredoxin y  39.85 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00024318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  38.38 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  39.42 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  39.42 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  42.11 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  42.11 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  43.68 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9748  predicted protein  37.14 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.82657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  42.11 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  36.27 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  35.58 
 
 		 107 aa  88.2  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  38.61 
 
 		 106 aa  87.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  37.37 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  43.68 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  87  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  37.86 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  37.14 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  32.73 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  32.73 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  34.62 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3868  Thioredoxin domain protein  36.73 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  40 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  30.77 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0160  thioredoxin-related  34.95 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  36.89 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  43.68 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  36.08 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  40.66 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  38.38 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  44.71 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  36.36 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3917  thioredoxin domain protein  37.11 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00595323  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  36.27 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  38.38 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  44.71 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  36.19 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  44.58 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2143  Thioredoxin domain protein  35.92 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  37.23 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  38.14 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  38.95 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  36.36 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  39.56 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  38.95 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  44.44 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  37.62 
 
 		 108 aa  84.3  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2231  thioredoxin  39.05 
 
 		 145 aa  84.3  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0118387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  36.27 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  34.31 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  37.5 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  36.27 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  35.29 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  36.54 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  36.36 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  34.95 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  39.62 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  36.54 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  37.08 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  37.37 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  36.89 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  33.04 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  37.93 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  35.79 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>