More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01370 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01370  thioredoxin C-2  100 
 
 		 98 aa  201  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.602659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1624  thioredoxin domain-containing protein  79.17 
 
 		 100 aa  164  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  48.98 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  41.84 
 
 		 98 aa  98.6  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1751  thioredoxin  45.05 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  39.8 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  40.62 
 
 		 98 aa  88.6  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6383  thioredoxin  41.49 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  38.95 
 
 		 229 aa  77.8  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  38.46 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  38.55 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  36.56 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  32.98 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  38.46 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  39.74 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  34.88 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  38.46 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  36.47 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  31.46 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  37.5 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  37.08 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  40.28 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  38.46 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  31.87 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  31.87 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  35.71 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  37.18 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  38.37 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  31.11 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  33.72 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  35.44 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  31.82 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  36.36 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  30.11 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  36.36 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  32.26 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  33.71 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  32.58 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  38.96 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  37.35 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  33.72 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  35.44 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  37.5 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  32.26 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  39.51 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1719  thioredoxin  34.25 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00129431  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  38.1 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  31.46 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  35.62 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  37.5 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  39.13 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  39.13 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  32.95 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3727  Thioredoxin domain  32.56 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  42.5 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  31.87 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  35.21 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  34.25 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  31.18 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  32 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  32.91 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  31.18 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  35.21 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  31.18 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  31.18 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  31.18 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  31.18 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  31.18 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  32.14 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  28.72 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  27.66 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  32.53 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5974  thioredoxin domain protein  29.03 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.897668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  34.72 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  33.33 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  32.14 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  34.25 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  32.53 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  32.88 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  30.34 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0238  thioredoxin, selenocysteine-containing  30.93 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  37.63 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  32.18 
 
 		 106 aa  62  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  30.34 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  34.62 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  35.21 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  34.09 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  31.87 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  40.28 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  34.18 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  29.03 
 
 		 223 aa  62  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>