More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3391 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  100 
 
 
119 aa  235  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  61.02 
 
 
120 aa  156  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  60.17 
 
 
119 aa  147  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  62.39 
 
 
119 aa  147  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  60.58 
 
 
136 aa  140  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  57.26 
 
 
147 aa  139  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  57.41 
 
 
113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  49.54 
 
 
159 aa  106  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  48.84 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  49.41 
 
 
280 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  46.43 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  39.8 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  49.45 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  46.43 
 
 
127 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  45.71 
 
 
109 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  46.43 
 
 
102 aa  91.3  4e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  44.66 
 
 
108 aa  91.3  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  46.07 
 
 
259 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  43.75 
 
 
105 aa  90.5  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  49.4 
 
 
280 aa  90.9  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  50 
 
 
104 aa  90.5  8e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  42.86 
 
 
104 aa  90.1  9e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  41.41 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  49.37 
 
 
108 aa  89.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  48.35 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  47.62 
 
 
110 aa  89.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  48.24 
 
 
310 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  47.62 
 
 
286 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  39.6 
 
 
109 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  46.99 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  46.43 
 
 
107 aa  89  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  45.78 
 
 
108 aa  88.6  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  51.95 
 
 
116 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 
287 aa  88.2  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  51.43 
 
 
114 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  43.62 
 
 
272 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  45.68 
 
 
272 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  43.37 
 
 
108 aa  87.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  43.37 
 
 
108 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  39.05 
 
 
108 aa  87.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  45.68 
 
 
272 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  43.37 
 
 
108 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  46.99 
 
 
272 aa  87.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  47.67 
 
 
104 aa  87  7e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  47.67 
 
 
104 aa  87  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  42.27 
 
 
105 aa  87  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  41.41 
 
 
108 aa  87  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  48.1 
 
 
109 aa  87  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  45.88 
 
 
104 aa  86.7  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  34.71 
 
 
146 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  42.53 
 
 
106 aa  86.7  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  38.46 
 
 
112 aa  87  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  44.05 
 
 
120 aa  86.7  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  43.02 
 
 
109 aa  86.7  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  46.51 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  44.05 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  48.24 
 
 
105 aa  86.7  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  42.05 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  38.46 
 
 
110 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  48.19 
 
 
282 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  46.25 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  48.19 
 
 
282 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  42.86 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  40 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  45.88 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  37.5 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  41.86 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  40.91 
 
 
109 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  42.86 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  39.53 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  44.05 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  40 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  42.86 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  41.38 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  43.68 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  40 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  46.99 
 
 
282 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  44.83 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  45.88 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  42.17 
 
 
269 aa  84.7  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  37.5 
 
 
107 aa  84.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  41.67 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  33.88 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  37.5 
 
 
107 aa  84.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  44.32 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  48.19 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  41.46 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  42.86 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  42.17 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  36.78 
 
 
108 aa  84.7  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  42.05 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  50 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  38.54 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  43.48 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  40.7 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  41.84 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  49.4 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  40.23 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  44.05 
 
 
302 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  39.53 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>