More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3640 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  100 
 
 
120 aa  244  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  68.91 
 
 
119 aa  177  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  66.39 
 
 
119 aa  169  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  61.02 
 
 
119 aa  156  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  55.56 
 
 
147 aa  141  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  50.89 
 
 
136 aa  130  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  58.76 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  46.08 
 
 
105 aa  101  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  42 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  47.25 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  47.78 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  47.78 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  47.78 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  41 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  41 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  48.35 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  45 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  47.83 
 
 
98 aa  94.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  43 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  45 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  45 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  41.49 
 
 
127 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  45 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  45 
 
 
108 aa  94  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  93.6  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  43 
 
 
108 aa  94  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  44 
 
 
108 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  44 
 
 
108 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  44 
 
 
108 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  40.78 
 
 
108 aa  93.6  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  44 
 
 
108 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  45.45 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  46.15 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  44 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  41.58 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  43.48 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  41.58 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  40.21 
 
 
114 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  44.44 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1772  thioredoxin  46.6 
 
 
105 aa  92  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000134775  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  44.44 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  47.17 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  45.05 
 
 
104 aa  92  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  44.44 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  41.76 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  42.57 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  44.9 
 
 
130 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  42.57 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  42.57 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  47.06 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  42.57 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  42.57 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  38.78 
 
 
104 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  43 
 
 
108 aa  92  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  42.57 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  42.57 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  41.58 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  44.05 
 
 
107 aa  91.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  45.05 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  44.05 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  48.31 
 
 
302 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  43.48 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  41.58 
 
 
108 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  41.58 
 
 
108 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  43.48 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  43.33 
 
 
108 aa  91.3  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  41.58 
 
 
108 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  41.58 
 
 
108 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  41.58 
 
 
108 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  42.86 
 
 
106 aa  90.9  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  41.58 
 
 
108 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  38.61 
 
 
108 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  38.61 
 
 
108 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  48.89 
 
 
109 aa  90.5  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  40.2 
 
 
110 aa  90.1  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  38.61 
 
 
110 aa  90.1  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  43.82 
 
 
107 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  41.58 
 
 
146 aa  90.1  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  40.66 
 
 
110 aa  90.1  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  42.31 
 
 
109 aa  90.5  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  40 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  45.35 
 
 
108 aa  89.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  43.33 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  39.18 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  49.45 
 
 
104 aa  90.1  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  43.33 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  43.33 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  44.44 
 
 
109 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  43.33 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  43.33 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  44.44 
 
 
108 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  43.33 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  43.33 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  43.33 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  43.33 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  46.94 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  43.33 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  40.66 
 
 
110 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  40.95 
 
 
108 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  43.33 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>