More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0694 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  100 
 
 
106 aa  216  7e-56  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  45.78 
 
 
105 aa  91.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  36.89 
 
 
107 aa  91.7  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  41.94 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  35.92 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  36.89 
 
 
107 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  35.92 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  36.89 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  36.89 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  41.67 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  36.89 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  41.3 
 
 
106 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  37.25 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  38.38 
 
 
272 aa  87.8  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  40.22 
 
 
106 aa  87.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  38.83 
 
 
105 aa  87.4  6e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  39.56 
 
 
268 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  38.82 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  42.67 
 
 
263 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  41.18 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  42.68 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  41.18 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  41.18 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  41.18 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  36.78 
 
 
109 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  43.21 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  41.38 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  41.18 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  41.18 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  41.18 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  40 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  41.18 
 
 
146 aa  84.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  41.18 
 
 
108 aa  84.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  41.18 
 
 
108 aa  84.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  41.18 
 
 
108 aa  84.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  41.18 
 
 
108 aa  84.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  40.24 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  41.18 
 
 
108 aa  84.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  41.18 
 
 
108 aa  84.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  41.18 
 
 
108 aa  84.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  45.07 
 
 
106 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  40 
 
 
141 aa  84.3  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  35.35 
 
 
106 aa  84  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  40.24 
 
 
113 aa  84  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  43.21 
 
 
104 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  38.82 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  39.02 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  39.02 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  38.82 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  43.37 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  40.48 
 
 
106 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  41.67 
 
 
108 aa  83.6  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  40.48 
 
 
106 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  37.65 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  39.02 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  40.23 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  33.98 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  34.41 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  41.98 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  35.29 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  42.35 
 
 
105 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  41.86 
 
 
109 aa  82  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  34.83 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  38.55 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  37.76 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  42.5 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  49.28 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  36.56 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  41.25 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  34.57 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  35.71 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  36.14 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  48.61 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  37.76 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  34.74 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  37.76 
 
 
108 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  30.68 
 
 
268 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  37.76 
 
 
108 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  40.23 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  37.76 
 
 
108 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  39.02 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  37.76 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  39.24 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  40.24 
 
 
109 aa  82  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  37.76 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  37.76 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  37.76 
 
 
108 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  37.76 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  35.79 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  36.67 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  38.75 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  39.29 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  38.75 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  38.75 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  40.96 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  38.55 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  38.46 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  37.04 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>