More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0275 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  100 
 
 		 169 aa  350  5e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0062  thioredoxin  43.86 
 
 		 117 aa  116  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  42.86 
 
 		 287 aa  95.5  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  47.19 
 
 		 110 aa  93.6  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  43.88 
 
 		 109 aa  92.8  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  44.66 
 
 		 106 aa  87.4  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  53.75 
 
 		 105 aa  86.7  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  37.63 
 
 		 107 aa  86.3  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  39.13 
 
 		 110 aa  85.5  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  42.53 
 
 		 102 aa  85.5  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  40.4 
 
 		 105 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  40.82 
 
 		 105 aa  85.1  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  39.8 
 
 		 105 aa  85.5  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  40.43 
 
 		 105 aa  85.1  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  41.05 
 
 		 108 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  37.76 
 
 		 106 aa  84.7  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  41.86 
 
 		 105 aa  85.1  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  41.3 
 
 		 302 aa  84  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  41.3 
 
 		 108 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  36.84 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  41.3 
 
 		 108 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  41.3 
 
 		 108 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  41.3 
 
 		 108 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  36.84 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  41.3 
 
 		 108 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  41.3 
 
 		 108 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  41.3 
 
 		 108 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  41.3 
 
 		 108 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  41.3 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  39.13 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  39.13 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  38.89 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  40.62 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  38.53 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  41.3 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  41.3 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  41.3 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  41.3 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  48.61 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  41.3 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  41.3 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  41.3 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  41.3 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  36.84 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  34.15 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  34.15 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  34.15 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  43.53 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  34.15 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  39.13 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  40.51 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  34.15 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  40.86 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  36.96 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  34.15 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  34.15 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  34.15 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  34.15 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  36.94 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  51.56 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  41.77 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  38.3 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  43.01 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  30.22 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  38.04 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  44.87 
 
 		 302 aa  80.9  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  42.35 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  39.25 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  40.22 
 
 		 318 aa  80.5  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  36 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  36.84 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  43.75 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  43.02 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  46.91 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  39.77 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  47.06 
 
 		 107 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  45.83 
 
 		 105 aa  80.5  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  35.58 
 
 		 108 aa  80.5  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  37.89 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  41.67 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  37.89 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  46.38 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  36.56 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  36.56 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  35.96 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  37.89 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  37.89 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  36.84 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  40.91 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  42.35 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  36.84 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  36.19 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  37.89 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  37.63 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  40.24 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>