More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1776 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  100 
 
 		 131 aa  268  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  67.77 
 
 		 125 aa  188  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  67.23 
 
 		 154 aa  186  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  65.55 
 
 		 120 aa  183  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  67.8 
 
 		 120 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  74.34 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  64.06 
 
 		 130 aa  177  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  64.46 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  60.16 
 
 		 132 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  60.16 
 
 		 132 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  64.17 
 
 		 131 aa  169  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  63.56 
 
 		 123 aa  168  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  59.35 
 
 		 124 aa  168  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  60 
 
 		 117 aa  163  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  59.84 
 
 		 123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  54.84 
 
 		 123 aa  160  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  57.63 
 
 		 123 aa  160  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  57.63 
 
 		 123 aa  160  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  60 
 
 		 131 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  60 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  59.52 
 
 		 126 aa  157  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  57.03 
 
 		 143 aa  156  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  57.98 
 
 		 123 aa  155  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  55.93 
 
 		 120 aa  156  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  54.1 
 
 		 125 aa  156  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  58.47 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  53.28 
 
 		 123 aa  154  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  61.47 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  57.39 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  57.5 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  55.47 
 
 		 130 aa  150  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  58.93 
 
 		 153 aa  150  8e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  52.07 
 
 		 124 aa  148  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  55.65 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  56.3 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  48.8 
 
 		 125 aa  147  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  52.5 
 
 		 124 aa  146  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  57.26 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  48.76 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  52.54 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  53.1 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  48 
 
 		 125 aa  144  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  51.67 
 
 		 124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  51.67 
 
 		 124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  52.5 
 
 		 123 aa  144  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  51.67 
 
 		 122 aa  143  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  50 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  50.43 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  47.93 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  49.59 
 
 		 140 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  50 
 
 		 120 aa  137  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  52.1 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  48.36 
 
 		 123 aa  130  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  52.07 
 
 		 121 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  52.07 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  51.24 
 
 		 121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  49.17 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  51.24 
 
 		 121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  54.13 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  42.62 
 
 		 121 aa  123  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  55.05 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  42.62 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  38.98 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  38.98 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  52.94 
 
 		 170 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  44.55 
 
 		 113 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  51.96 
 
 		 170 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  49.52 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  51.96 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  51.96 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  41.96 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  48.57 
 
 		 178 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  52.43 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  47.57 
 
 		 140 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  48.04 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  48.04 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  50 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  44.12 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  36.44 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  46.53 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  44.66 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  40.59 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  40.82 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  46.53 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  43.56 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  40.21 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  42 
 
 		 285 aa  90.9  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2251  Thioredoxin domain protein  39.32 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.32893  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  39.6 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  38.61 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  44.21 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  44.66 
 
 		 107 aa  90.1  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  44.66 
 
 		 107 aa  90.1  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  44.79 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  43.56 
 
 		 285 aa  89.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  43.75 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  40.59 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  40.59 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  40.59 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  38.61 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>