More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1900 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  66.67 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  58.47 
 
 		 122 aa  157  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  56.78 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  57.63 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  56.78 
 
 		 124 aa  150  7e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  55.46 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  59.13 
 
 		 117 aa  147  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  54.24 
 
 		 120 aa  145  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  52.03 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  52.54 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  57.98 
 
 		 121 aa  145  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  57.85 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  49.19 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  50 
 
 		 132 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  50 
 
 		 132 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  49.58 
 
 		 125 aa  139  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  53.45 
 
 		 123 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  53.57 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  51.26 
 
 		 122 aa  137  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  49.19 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  52.17 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  47.93 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  53.45 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  53.57 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  50 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  55 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  52.68 
 
 		 123 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  46.77 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  49.59 
 
 		 123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  52.17 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  46.61 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  50.91 
 
 		 123 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  52.73 
 
 		 120 aa  126  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  46.34 
 
 		 124 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  47.5 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  47.46 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  46.34 
 
 		 124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  46.34 
 
 		 124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  46.61 
 
 		 123 aa  125  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  46.61 
 
 		 123 aa  125  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  47.01 
 
 		 137 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  48 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  50.43 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  44.26 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  43.09 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  47.46 
 
 		 123 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  43.44 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  47.79 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  41.13 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  47.46 
 
 		 120 aa  113  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  50.46 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  40.83 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  47.93 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  47.93 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  45.13 
 
 		 126 aa  110  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  47.93 
 
 		 121 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  49.17 
 
 		 120 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  43.12 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  44.04 
 
 		 123 aa  104  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  35.29 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  35.29 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  40.18 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  36.13 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  42.73 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  36.54 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  36.54 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  45.1 
 
 		 124 aa  83.6  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  33.98 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2251  Thioredoxin domain protein  40.18 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.32893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  37.14 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  37.25 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  36.19 
 
 		 178 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  37.25 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  40.86 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  36.27 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  36.27 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  38.55 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  36.27 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  36.27 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  36.27 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  42.05 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  36.36 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  36.36 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  36.63 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  36.46 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  34.29 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  34.44 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  34.44 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  32 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  34.44 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  38.24 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  36.63 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  30.48 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  33.66 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  37.78 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  33.91 
 
 		 289 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  38.53 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  43.02 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  38.54 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>