More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0303 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  100 
 
 
126 aa  257  4e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  58.87 
 
 
125 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  59.5 
 
 
123 aa  157  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  62.61 
 
 
123 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  62.61 
 
 
123 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  58.12 
 
 
127 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  59.13 
 
 
126 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  53.72 
 
 
131 aa  148  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  55.08 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  55.65 
 
 
122 aa  142  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  55.65 
 
 
125 aa  142  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  53.72 
 
 
123 aa  141  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  50.41 
 
 
132 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  50.41 
 
 
132 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  50.82 
 
 
131 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  52.07 
 
 
123 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  47.93 
 
 
131 aa  138  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  51.61 
 
 
123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  47.97 
 
 
124 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  55.2 
 
 
126 aa  136  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  47.97 
 
 
124 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  47.54 
 
 
123 aa  136  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  54.78 
 
 
126 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  51.3 
 
 
120 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  50.42 
 
 
154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  55.05 
 
 
122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  52.17 
 
 
123 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  46.34 
 
 
124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  47.15 
 
 
124 aa  133  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  53.91 
 
 
120 aa  133  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  51.3 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  50 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  50 
 
 
143 aa  131  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  51.33 
 
 
126 aa  131  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  49.57 
 
 
125 aa  130  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  53.78 
 
 
130 aa  130  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  46.15 
 
 
125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  51.89 
 
 
121 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  45.3 
 
 
125 aa  127  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  46.09 
 
 
130 aa  127  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  51.67 
 
 
122 aa  126  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  53.72 
 
 
121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  53.72 
 
 
121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  50 
 
 
123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  49.15 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  49.56 
 
 
139 aa  124  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  50 
 
 
153 aa  124  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  50.43 
 
 
123 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  52.89 
 
 
121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  48.6 
 
 
137 aa  123  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  46.72 
 
 
140 aa  123  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  48.18 
 
 
117 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  54.21 
 
 
120 aa  121  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  54.13 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  42.48 
 
 
121 aa  117  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  42.48 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  52.83 
 
 
120 aa  113  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  43.55 
 
 
123 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  46.67 
 
 
120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  40.87 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  46.34 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  39.83 
 
 
120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  43.75 
 
 
124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  45.13 
 
 
125 aa  110  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  39.83 
 
 
120 aa  110  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  56.12 
 
 
170 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  56.12 
 
 
170 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  51.96 
 
 
178 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  55.1 
 
 
170 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  55.1 
 
 
140 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  55.1 
 
 
140 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  55.1 
 
 
170 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  54.08 
 
 
140 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  51.02 
 
 
140 aa  102  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  47.06 
 
 
139 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  50 
 
 
139 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  50 
 
 
139 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  48.48 
 
 
145 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  50 
 
 
139 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  50 
 
 
139 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  50 
 
 
139 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  46.08 
 
 
140 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  48.96 
 
 
139 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  48.96 
 
 
139 aa  100  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  48.96 
 
 
139 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  48.96 
 
 
139 aa  100  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  48.96 
 
 
139 aa  100  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  48.96 
 
 
139 aa  100  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  48.96 
 
 
139 aa  100  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  48.96 
 
 
139 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  48.96 
 
 
139 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  47.47 
 
 
145 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  47.47 
 
 
145 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  48.48 
 
 
139 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  46.88 
 
 
139 aa  99  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  49.46 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  45.1 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  48.48 
 
 
139 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  40.34 
 
 
121 aa  96.7  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  46 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>