More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2770 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  100 
 
 		 125 aa  257  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  67.77 
 
 		 131 aa  188  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  63.93 
 
 		 154 aa  179  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  63.87 
 
 		 121 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  66.37 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  61.34 
 
 		 124 aa  167  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  63.56 
 
 		 120 aa  167  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  61.86 
 
 		 120 aa  166  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  60.16 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  60.16 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  59.17 
 
 		 123 aa  164  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  60.98 
 
 		 131 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  63.25 
 
 		 131 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  61.48 
 
 		 123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  57.63 
 
 		 123 aa  157  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  57.63 
 
 		 123 aa  157  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  56.2 
 
 		 125 aa  157  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  59.32 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  64.75 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  58.2 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  61.02 
 
 		 123 aa  154  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  56.78 
 
 		 123 aa  154  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  61.74 
 
 		 125 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  59.13 
 
 		 126 aa  153  7e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  57.63 
 
 		 130 aa  153  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  58.2 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  55.75 
 
 		 126 aa  151  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  56.41 
 
 		 117 aa  150  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  62.39 
 
 		 122 aa  150  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  63.03 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  56.9 
 
 		 120 aa  150  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  57.38 
 
 		 124 aa  150  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  57.38 
 
 		 124 aa  150  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  57.85 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  57.5 
 
 		 123 aa  147  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  58.26 
 
 		 126 aa  146  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  55.74 
 
 		 124 aa  147  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  53.28 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  50 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  53.28 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  52.89 
 
 		 123 aa  144  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  53.72 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  54.31 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  49.58 
 
 		 125 aa  139  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  50.43 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  50.43 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  53.57 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  53.33 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  52.99 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  50.82 
 
 		 125 aa  137  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  50 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  49.57 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  50.93 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  55.05 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  50 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  55.05 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  55.05 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  54.13 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  42.15 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  42.15 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  52.29 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  54.13 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  45.54 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  48.57 
 
 		 178 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  40.68 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  40.68 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  53.06 
 
 		 170 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  46.79 
 
 		 140 aa  105  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  52.04 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  52.04 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  51.96 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  52.04 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  50 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  43.64 
 
 		 113 aa  103  8e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  51.02 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  36.97 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  52.58 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  52.75 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  44.12 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  46.6 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  50.54 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  49 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  48.48 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  42.71 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  46.67 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  41.35 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  44 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  42.39 
 
 		 135 aa  94  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2251  Thioredoxin domain protein  42.74 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.32893  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  38.38 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  45.54 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  44.55 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  44.44 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  44.55 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  44.55 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  46.15 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  44.55 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  44.55 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  36.36 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  53.19 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>