More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2576 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  100 
 
 		 123 aa  249  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  86.99 
 
 		 123 aa  215  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  66.67 
 
 		 120 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  70.73 
 
 		 130 aa  168  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  74.36 
 
 		 126 aa  167  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  63.33 
 
 		 122 aa  163  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  59.84 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  61.48 
 
 		 125 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  60.66 
 
 		 123 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  63.48 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  59.35 
 
 		 123 aa  160  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  62.5 
 
 		 124 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  63.48 
 
 		 126 aa  160  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  61.67 
 
 		 124 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  61.67 
 
 		 124 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  61.21 
 
 		 120 aa  157  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  59.02 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  57.38 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  59.02 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  58.82 
 
 		 120 aa  155  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  55.93 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  58.82 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  59.84 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  57.5 
 
 		 124 aa  153  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  61.74 
 
 		 117 aa  153  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  64.22 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  57.38 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  56.56 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  62.71 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  62.93 
 
 		 121 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  54.47 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  63.39 
 
 		 139 aa  151  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  53.66 
 
 		 140 aa  150  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  56.3 
 
 		 137 aa  150  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  59.82 
 
 		 126 aa  150  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  64.55 
 
 		 120 aa  150  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  58.26 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  55.83 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  58.62 
 
 		 123 aa  147  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  59.13 
 
 		 125 aa  147  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  53.78 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  51.64 
 
 		 125 aa  143  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  57.72 
 
 		 123 aa  144  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  51.64 
 
 		 123 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  54.7 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  54.7 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  59.82 
 
 		 143 aa  140  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  53.28 
 
 		 122 aa  140  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  56.25 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  52.07 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  53.45 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  50 
 
 		 123 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  56.67 
 
 		 120 aa  134  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  44.72 
 
 		 123 aa  133  8e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  58.72 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  54.55 
 
 		 121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  54.55 
 
 		 121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  54.55 
 
 		 121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  57.8 
 
 		 120 aa  123  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  48.78 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  41.07 
 
 		 121 aa  114  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  41.07 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2251  Thioredoxin domain protein  47.32 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.32893  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  47.52 
 
 		 178 aa  100  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  44.23 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  52.94 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  54.76 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  54.76 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  48.54 
 
 		 170 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  39.29 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  43.12 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  49.41 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  55.56 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  47.57 
 
 		 170 aa  95.9  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  53.01 
 
 		 170 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  53.01 
 
 		 170 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  47.42 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  39.29 
 
 		 124 aa  94.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  41.3 
 
 		 135 aa  94.4  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  47.96 
 
 		 140 aa  93.2  9e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  45.19 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  41.67 
 
 		 104 aa  90.5  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  41.59 
 
 		 110 aa  90.1  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  38 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  45.65 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2066  thioredoxin  40 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0918718  normal  0.219337 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  43.14 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  48.31 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2231  thioredoxin  46.43 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0118387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  50.54 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  45.1 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  53.01 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  48.48 
 
 		 145 aa  87.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  53.25 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  46.94 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  45.65 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  40 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>