More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2493 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  100 
 
 		 154 aa  321  3e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0227  thioredoxin  44.36 
 
 		 138 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0097  thioredoxin  48.09 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0588  thioredoxin  42.14 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.99153  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1670  thioredoxin  44.26 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  47.06 
 
 		 105 aa  114  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  41.22 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  45.36 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  47.96 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  37.31 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  45.28 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  49.49 
 
 		 104 aa  111  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  50 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  42.86 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  40.17 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  47.47 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  46.94 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  36.92 
 
 		 135 aa  110  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  45.83 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  47.31 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  46.6 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  45.83 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  41 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  46.46 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  47.92 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  45.1 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  45.45 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  45.74 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  46.39 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  45.74 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  41.58 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  45.74 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  46.24 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  50.53 
 
 		 109 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  48.48 
 
 		 104 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  44.33 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  46.24 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  44.33 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  45.26 
 
 		 107 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  47.47 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  47.57 
 
 		 238 aa  107  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  43.75 
 
 		 105 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  45.54 
 
 		 105 aa  107  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  48 
 
 		 110 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  45.16 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  43.3 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  40.38 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  44.9 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  43.56 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  46.81 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  46.24 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  44.09 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  44.44 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  36.19 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  48.39 
 
 		 108 aa  105  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  43.43 
 
 		 109 aa  105  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  44.68 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  44.33 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  46.24 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  44.44 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  46.24 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  43.56 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  45.16 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  45.45 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  44.44 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  43.3 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  45.1 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  44.33 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  36.54 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  40.38 
 
 		 110 aa  104  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  42.27 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  44.44 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  45.45 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  42.42 
 
 		 109 aa  103  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  103  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  43.75 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  35 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  35 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  35 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  44.09 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  42.31 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  41.41 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  35 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  35 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  41.41 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  35 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  36.51 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  35 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  35 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  35 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  40 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  43.48 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  49.35 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  41.84 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  41.84 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>