More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11499 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  100 
 
 		 123 aa  255  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  75.21 
 
 		 121 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  74.38 
 
 		 121 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  74.38 
 
 		 121 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  71.67 
 
 		 120 aa  176  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  64.29 
 
 		 122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  64.17 
 
 		 120 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  62.04 
 
 		 124 aa  153  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  61.11 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  61.11 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  55 
 
 		 124 aa  147  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  59.26 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  58.33 
 
 		 125 aa  144  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  59.26 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  58.72 
 
 		 122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  55.96 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  55.05 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  55.05 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  55.96 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  52.07 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  52.94 
 
 		 123 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  55.96 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  54.63 
 
 		 123 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  54.13 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  55.96 
 
 		 140 aa  134  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  64.22 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  52.34 
 
 		 131 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  54.78 
 
 		 124 aa  133  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  48.78 
 
 		 123 aa  133  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  52.29 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  52.29 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  52.29 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  50.41 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  46.34 
 
 		 125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  51.4 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  53.21 
 
 		 120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  46.34 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  52.29 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  49.53 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  49.53 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  48.62 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  50.46 
 
 		 123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  50.46 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  50.46 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  50.43 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  51.43 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  46.34 
 
 		 123 aa  125  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  48.76 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  49.54 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  46.34 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  44.04 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  45.53 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  45.87 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  53.21 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  44.04 
 
 		 123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  54.63 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  45.87 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  44.95 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  48.62 
 
 		 122 aa  114  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  44.04 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  43.12 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  45.79 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  45.1 
 
 		 124 aa  103  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  46.67 
 
 		 178 aa  97.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  47.17 
 
 		 170 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  47.47 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  47.47 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  46.3 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  43.14 
 
 		 140 aa  96.7  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  36.27 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  47.12 
 
 		 170 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  47.12 
 
 		 170 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  44.76 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  36.27 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  47.12 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  45.37 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  46.39 
 
 		 139 aa  94.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  47.52 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  45.45 
 
 		 146 aa  94  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  44.94 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  46.39 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  37.04 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  46.15 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  44.23 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  31.67 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  44.33 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  44.33 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  44.33 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  44.33 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  44.33 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  44.33 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  44.33 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  44.33 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  44 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  44.33 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  31.67 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  43.27 
 
 		 144 aa  91.3  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  43.3 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  43.3 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  44.33 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>