More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1185 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  100 
 
 
121 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  53.57 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  43.22 
 
 
154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  42.86 
 
 
153 aa  114  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  40.68 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  43.22 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  43.22 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  39.82 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  41.53 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  40.17 
 
 
120 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  41.88 
 
 
117 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  45.54 
 
 
127 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  40.68 
 
 
123 aa  105  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  40.68 
 
 
143 aa  104  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  39.32 
 
 
120 aa  104  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  40.52 
 
 
124 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  38.6 
 
 
126 aa  104  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  38.14 
 
 
124 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  36.97 
 
 
125 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  38.14 
 
 
124 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  38.14 
 
 
124 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  37.5 
 
 
125 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  37.93 
 
 
123 aa  101  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  36.44 
 
 
131 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  39.32 
 
 
123 aa  101  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  38.98 
 
 
130 aa  100  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  36.21 
 
 
130 aa  100  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  38.94 
 
 
126 aa  100  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  38.14 
 
 
122 aa  100  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  38.14 
 
 
124 aa  100  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  34.78 
 
 
131 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  40.54 
 
 
125 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  39.64 
 
 
125 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  39.29 
 
 
123 aa  98.2  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  35.29 
 
 
121 aa  97.8  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  35.29 
 
 
121 aa  97.8  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  41.18 
 
 
126 aa  98.2  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  37.82 
 
 
123 aa  97.8  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  41.38 
 
 
120 aa  97.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  34.23 
 
 
132 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  34.23 
 
 
132 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  40.34 
 
 
126 aa  96.7  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  36.21 
 
 
137 aa  96.7  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  36.13 
 
 
123 aa  95.9  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  34.75 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  34.23 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  38.46 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  38.89 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  40.18 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  36.13 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  37.61 
 
 
120 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  37.17 
 
 
139 aa  93.6  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  33.05 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  39.45 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  39.81 
 
 
122 aa  92  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  34.78 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  33.05 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  35.04 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  32.2 
 
 
120 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  33.9 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  39.81 
 
 
120 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  36 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  38.89 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  38.89 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  38.89 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  34.55 
 
 
113 aa  84.3  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  37.04 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  33.98 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  34.26 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  29.41 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  38.78 
 
 
106 aa  77  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  44.71 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  39.42 
 
 
107 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  37.62 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  35.29 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  35.92 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  38.46 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  36.36 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  44.3 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1614  thioredoxin  31.58 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  32.32 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  32.35 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  33.98 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  39.42 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  35.35 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  35.29 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  35.29 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  34.34 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  36.73 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  36.63 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  37.89 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  36.08 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  38 
 
 
293 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  37.89 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  37.74 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  31.96 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  32.98 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  34.65 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  35.51 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  32.98 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>