More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0356 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  100 
 
 		 113 aa  232  2.0000000000000002e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  62.14 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  49.53 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  44.55 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  43.64 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  45.79 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  44.55 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  43.64 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  43.52 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  43.52 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  43.12 
 
 		 123 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  43.12 
 
 		 123 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  42.73 
 
 		 125 aa  116  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  44.55 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  45.45 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  48.62 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  46.53 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  46.53 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  46.53 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  45.79 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  42.59 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  45.45 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  43.64 
 
 		 125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  43.64 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  43.93 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  43.93 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  43.12 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  44.86 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  45.45 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  45.45 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  46.79 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  42.73 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  43.64 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  44.55 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  44.95 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  43.12 
 
 		 123 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  41.82 
 
 		 122 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  45.87 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  41.82 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  43.93 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  45.87 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  47.71 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  41.82 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  41.82 
 
 		 140 aa  106  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  45.79 
 
 		 123 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  45.45 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  39.81 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  40.37 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  40.19 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  42.48 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  41.28 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  40 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  42.73 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  45.45 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  40.19 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  37.38 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  37.61 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  45.16 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  41.82 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  45.16 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  35.78 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  35.78 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  39.09 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  37.38 
 
 		 123 aa  96.7  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  43.48 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  40.19 
 
 		 120 aa  93.6  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  39.6 
 
 		 178 aa  91.3  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  38.83 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  39.22 
 
 		 170 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  34.55 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  39.22 
 
 		 170 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  39.22 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  50.67 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  39.22 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  40.59 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  39.22 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  40.2 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  40.2 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  37.63 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  39.6 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  39.6 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  39.6 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  39.6 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  39.6 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  35.51 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  40.86 
 
 		 98 aa  87  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  33.33 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  40.2 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  44.57 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  42.7 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  42.7 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  42.7 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  43.14 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  44.21 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  42.7 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  42.7 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  40.74 
 
 		 285 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  42.7 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  42.7 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  42.7 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>