More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0125 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  100 
 
 		 124 aa  256  7e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  61.86 
 
 		 123 aa  161  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  60.17 
 
 		 120 aa  159  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  58.2 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  58.2 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  56.3 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  61.61 
 
 		 117 aa  157  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  52.42 
 
 		 140 aa  156  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  56.3 
 
 		 120 aa  154  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  53.78 
 
 		 122 aa  153  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  56.56 
 
 		 131 aa  153  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  54.1 
 
 		 122 aa  153  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  54.47 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  53.72 
 
 		 154 aa  151  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  55 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  54.92 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  53.66 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  56.78 
 
 		 125 aa  150  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  52.07 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  57.14 
 
 		 130 aa  146  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  51.22 
 
 		 123 aa  146  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  52.85 
 
 		 123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  50 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  51.69 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  49.18 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  54.78 
 
 		 125 aa  144  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  48.36 
 
 		 125 aa  144  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  53.91 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  52.89 
 
 		 143 aa  143  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  53.39 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  50 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  51.69 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  54.7 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  53.04 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  50 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  52.68 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  50 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  51.72 
 
 		 124 aa  140  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  53.78 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  54.46 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  48.33 
 
 		 123 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  49.59 
 
 		 123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  50 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  50.83 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  48.7 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  55.65 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  47.54 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  53.39 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  49.15 
 
 		 123 aa  133  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  49.15 
 
 		 123 aa  133  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  43.9 
 
 		 123 aa  130  6.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  54.13 
 
 		 122 aa  130  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  49.17 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  46.77 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  50.46 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  45.97 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  45.97 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  40.87 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  50.42 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  44.04 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  43.93 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  46.08 
 
 		 124 aa  103  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  38.14 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  38.14 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  45.71 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  41.75 
 
 		 140 aa  97.8  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  37.38 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  37.38 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  44.12 
 
 		 170 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  44.55 
 
 		 178 aa  96.3  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  43.14 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  43.14 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  44.12 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  43.14 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  44.12 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  35.71 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  43.14 
 
 		 170 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  43.14 
 
 		 170 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  33.05 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  40.59 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  35.78 
 
 		 124 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  42.16 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  43.88 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  41.18 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  46.08 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  40.82 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  36.36 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  38.68 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  47.25 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  40.4 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  35 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  45.26 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  44.58 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  45.1 
 
 		 144 aa  84.3  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  42.11 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  43 
 
 		 285 aa  84.3  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  38.61 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  39.6 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  38.61 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  38.61 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>