More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0609 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  100 
 
 
125 aa  253  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  61.48 
 
 
125 aa  161  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  61.67 
 
 
123 aa  161  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  56.8 
 
 
131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  60 
 
 
125 aa  160  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  56.1 
 
 
132 aa  159  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  56.1 
 
 
132 aa  159  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  56.91 
 
 
131 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  61.86 
 
 
120 aa  157  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  61.74 
 
 
126 aa  157  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  55.28 
 
 
154 aa  156  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  57.38 
 
 
122 aa  155  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  56.2 
 
 
131 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  55.28 
 
 
124 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  60.5 
 
 
123 aa  154  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  55.74 
 
 
124 aa  154  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  55.28 
 
 
124 aa  153  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  55.28 
 
 
124 aa  153  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  58.82 
 
 
120 aa  153  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  57.38 
 
 
123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  58.33 
 
 
123 aa  150  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  60.71 
 
 
139 aa  150  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  56.78 
 
 
123 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  56.78 
 
 
123 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  54.92 
 
 
122 aa  150  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  54.4 
 
 
130 aa  150  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  58.93 
 
 
153 aa  149  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  59.13 
 
 
126 aa  149  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  62.1 
 
 
126 aa  149  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  48.8 
 
 
125 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  53.23 
 
 
126 aa  147  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  55.08 
 
 
120 aa  147  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  48 
 
 
125 aa  147  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  57.14 
 
 
126 aa  147  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  57.5 
 
 
123 aa  147  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  55.17 
 
 
124 aa  146  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  54.24 
 
 
123 aa  146  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  58.26 
 
 
117 aa  146  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  53.28 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  52.03 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  54.62 
 
 
137 aa  144  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  57.85 
 
 
123 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  57.26 
 
 
121 aa  143  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  56.52 
 
 
127 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  49.59 
 
 
123 aa  141  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  58.72 
 
 
122 aa  140  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  57.6 
 
 
130 aa  140  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  52.42 
 
 
125 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  54.17 
 
 
120 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  54.17 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  56.41 
 
 
149 aa  136  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  55.83 
 
 
120 aa  133  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  52.1 
 
 
122 aa  132  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  54.62 
 
 
121 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  54.62 
 
 
121 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  54.62 
 
 
121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  54.13 
 
 
120 aa  123  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  46.4 
 
 
123 aa  122  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  52.1 
 
 
120 aa  120  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  46.4 
 
 
123 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  48.21 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  42.02 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  42.02 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  49.04 
 
 
140 aa  110  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  50 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  50.96 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  50.96 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  50 
 
 
170 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  49.04 
 
 
170 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  49.04 
 
 
170 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  36.44 
 
 
120 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  36.44 
 
 
120 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  49.04 
 
 
140 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  49.04 
 
 
170 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  46.67 
 
 
178 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  47.06 
 
 
124 aa  104  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  50.98 
 
 
140 aa  104  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  35.59 
 
 
121 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  43.12 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  49 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  49 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  45.19 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  50 
 
 
162 aa  92  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  48.48 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  44.79 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  48.98 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  43.3 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  51.72 
 
 
149 aa  88.2  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  45.05 
 
 
140 aa  87.8  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  50 
 
 
159 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  46.6 
 
 
144 aa  87.4  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  35.58 
 
 
124 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  47.19 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  46.07 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  48.98 
 
 
144 aa  87  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  41.67 
 
 
140 aa  85.9  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  44.09 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2066  thioredoxin  37.5 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0918718  normal  0.219337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  44.09 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  44.09 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>