More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1832 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  100 
 
 
125 aa  259  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  98.4 
 
 
125 aa  257  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  82.11 
 
 
124 aa  215  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  81.3 
 
 
124 aa  213  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  81.3 
 
 
124 aa  213  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  80.49 
 
 
124 aa  209  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  63.93 
 
 
122 aa  167  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  60.87 
 
 
126 aa  155  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  57.38 
 
 
123 aa  152  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  57.39 
 
 
126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  56.1 
 
 
123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  52 
 
 
130 aa  151  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  56.9 
 
 
120 aa  150  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  61.16 
 
 
126 aa  149  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  54.62 
 
 
120 aa  148  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  54.92 
 
 
140 aa  148  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  57.5 
 
 
123 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  55 
 
 
123 aa  148  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  55.83 
 
 
120 aa  148  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  53.6 
 
 
123 aa  147  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  61.47 
 
 
122 aa  147  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  56.9 
 
 
137 aa  147  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  55.86 
 
 
126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  51.61 
 
 
124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  59.82 
 
 
143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  54.24 
 
 
123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  51.22 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  49.18 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  55.65 
 
 
117 aa  144  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  48 
 
 
131 aa  144  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  51.24 
 
 
125 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  59.5 
 
 
121 aa  141  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  48.8 
 
 
125 aa  140  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  59.5 
 
 
121 aa  140  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  59.5 
 
 
121 aa  141  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  53.45 
 
 
123 aa  140  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  50.41 
 
 
131 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  54.4 
 
 
130 aa  138  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  48.76 
 
 
132 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  48.76 
 
 
132 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  48.78 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  50.82 
 
 
125 aa  137  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  46.72 
 
 
122 aa  137  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  53.57 
 
 
139 aa  137  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  49.57 
 
 
121 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  59.17 
 
 
120 aa  135  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  52.68 
 
 
153 aa  135  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  55.05 
 
 
120 aa  134  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  48.7 
 
 
127 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  57.14 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  58.33 
 
 
123 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  55 
 
 
120 aa  130  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  50 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  43.9 
 
 
123 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  43.9 
 
 
123 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  50.86 
 
 
122 aa  127  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  48.8 
 
 
123 aa  128  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  42.98 
 
 
123 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  45.3 
 
 
126 aa  127  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  44.26 
 
 
125 aa  121  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  43.64 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  46.08 
 
 
124 aa  107  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  43.81 
 
 
124 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  40.54 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  33.05 
 
 
120 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  33.05 
 
 
120 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  44 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  34.58 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  34.58 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  36.04 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  41.58 
 
 
170 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  42.35 
 
 
178 aa  87.8  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  40.59 
 
 
170 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  40.59 
 
 
170 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  45.68 
 
 
170 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  44.44 
 
 
140 aa  84  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2251  Thioredoxin domain protein  42.59 
 
 
122 aa  84  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.32893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  40 
 
 
140 aa  84  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  40.59 
 
 
108 aa  84  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  35.35 
 
 
104 aa  83.6  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  45.65 
 
 
106 aa  84  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  39 
 
 
140 aa  84  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  44.44 
 
 
140 aa  84  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  44.44 
 
 
140 aa  83.6  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  38.61 
 
 
135 aa  83.6  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  47.25 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  41.3 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  47.87 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  49.48 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  45.45 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  40 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  43.21 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  40.4 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  40.4 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  39.58 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  41.38 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  42.53 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  40.59 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  43.68 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  40.66 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>