More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0987 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  100 
 
 		 124 aa  258  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  83.87 
 
 		 124 aa  223  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  83.06 
 
 		 124 aa  221  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  83.06 
 
 		 124 aa  221  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  80.49 
 
 		 125 aa  209  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  78.86 
 
 		 125 aa  207  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  68.03 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  64.81 
 
 		 122 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  61.74 
 
 		 126 aa  156  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  60 
 
 		 126 aa  156  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  56.2 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  57.5 
 
 		 123 aa  153  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  57.72 
 
 		 123 aa  153  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  58.47 
 
 		 120 aa  151  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  58.87 
 
 		 123 aa  151  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  62.71 
 
 		 126 aa  151  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  62.5 
 
 		 143 aa  150  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  55.83 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  65.74 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  65.74 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  57.39 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  56.25 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  55.46 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  65.74 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  55.74 
 
 		 125 aa  147  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  56.9 
 
 		 117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  54.62 
 
 		 120 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  52.5 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  52.42 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  55.65 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  54.84 
 
 		 140 aa  143  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  59.66 
 
 		 120 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  50 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  54.78 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  53.04 
 
 		 125 aa  141  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  54.78 
 
 		 123 aa  140  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  52.5 
 
 		 123 aa  140  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  50.41 
 
 		 132 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  50.41 
 
 		 132 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  53.78 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  56.52 
 
 		 137 aa  139  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  50.43 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  50.41 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  60.19 
 
 		 120 aa  137  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  52.14 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  53.57 
 
 		 139 aa  137  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  47.54 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  47.46 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  55 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  47.46 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  49.14 
 
 		 122 aa  134  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  54.46 
 
 		 122 aa  134  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  46.34 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  50.89 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  54.63 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  52.68 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  51.82 
 
 		 123 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  43.48 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  54.39 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  43.09 
 
 		 125 aa  121  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  38.14 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  38.14 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  50.49 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  45.79 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  46.15 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  38.14 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  37.38 
 
 		 121 aa  100  9e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  37.38 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  36.61 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  43.43 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  40.38 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  40.59 
 
 		 170 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  39.18 
 
 		 178 aa  88.2  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  44.44 
 
 		 140 aa  87.4  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  44.44 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  43.21 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  43.21 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  43.21 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  41.98 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  35.05 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  45.65 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  38.82 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  43.21 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3472  thioredoxin  43.3 
 
 		 246 aa  83.6  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  43.18 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  38.38 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  41.41 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  41.41 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  42.11 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  40.22 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  43.82 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  41.49 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  42.39 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  41.3 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  40.22 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  51.81 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  41.24 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  37.93 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>