More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0362 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  100 
 
 
127 aa  258  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  73.77 
 
 
123 aa  192  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  63.11 
 
 
125 aa  169  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  60.66 
 
 
123 aa  165  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  59.35 
 
 
124 aa  164  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  63.48 
 
 
120 aa  161  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  58.2 
 
 
123 aa  161  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  61.02 
 
 
123 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  61.02 
 
 
123 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  56.91 
 
 
126 aa  156  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  60.32 
 
 
126 aa  154  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  54.92 
 
 
123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  54.4 
 
 
140 aa  150  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  56.69 
 
 
130 aa  149  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  49.21 
 
 
131 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  58.26 
 
 
126 aa  149  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  51.67 
 
 
131 aa  146  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  55.46 
 
 
137 aa  146  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  50.4 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  58.93 
 
 
153 aa  144  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  57.14 
 
 
126 aa  144  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  49.21 
 
 
154 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  56.52 
 
 
125 aa  143  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  48.39 
 
 
124 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  48.39 
 
 
124 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  48.39 
 
 
124 aa  142  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  48.41 
 
 
131 aa  141  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  53.78 
 
 
122 aa  142  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  58.04 
 
 
126 aa  142  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  56.52 
 
 
123 aa  141  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  48.76 
 
 
125 aa  141  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  52.1 
 
 
120 aa  141  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  54.13 
 
 
122 aa  140  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  48.74 
 
 
124 aa  139  9e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  51.24 
 
 
122 aa  139  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  49.17 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  49.17 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  55.08 
 
 
123 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  47.58 
 
 
124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  46.4 
 
 
125 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  45.6 
 
 
125 aa  138  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  51.79 
 
 
139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  48.31 
 
 
123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  53.45 
 
 
117 aa  137  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  52.46 
 
 
143 aa  134  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  47.97 
 
 
123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  50.93 
 
 
121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  46.67 
 
 
120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  50 
 
 
120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  51.79 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  52.89 
 
 
121 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  52.89 
 
 
121 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  51.26 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  52.07 
 
 
121 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  47.54 
 
 
122 aa  122  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  46.49 
 
 
123 aa  122  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  46.03 
 
 
125 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  50.44 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  49.54 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  46.43 
 
 
124 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  39.17 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  39.17 
 
 
120 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  45.54 
 
 
121 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  35.71 
 
 
121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  35.71 
 
 
121 aa  107  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  40.16 
 
 
123 aa  103  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  46.08 
 
 
124 aa  101  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  39.42 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  41.58 
 
 
105 aa  90.5  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  44.12 
 
 
178 aa  90.5  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  50.65 
 
 
140 aa  90.1  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  41 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  41 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  41 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  44.9 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  44.9 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  40.2 
 
 
140 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  44.9 
 
 
140 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  37.61 
 
 
113 aa  88.2  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  44.12 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  47.78 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  43.56 
 
 
170 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  43.88 
 
 
170 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  37.8 
 
 
287 aa  87.4  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  39.18 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  43.88 
 
 
170 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  43.88 
 
 
170 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  44.21 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  44.21 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  43.88 
 
 
144 aa  86.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  39 
 
 
109 aa  86.7  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  43.88 
 
 
144 aa  86.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  42.27 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  42.27 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  42.27 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  40.4 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  37.76 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  41.58 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  47.31 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  43.16 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>