More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3068 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  100 
 
 
137 aa  280  6.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  87.05 
 
 
140 aa  249  8.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  73.21 
 
 
126 aa  174  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  69.09 
 
 
120 aa  169  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  66.4 
 
 
123 aa  167  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  65.55 
 
 
123 aa  166  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  64.75 
 
 
122 aa  166  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  56.45 
 
 
124 aa  164  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  69.17 
 
 
120 aa  163  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  63.08 
 
 
143 aa  163  9e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  62.93 
 
 
120 aa  161  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  65.22 
 
 
126 aa  159  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  68.97 
 
 
126 aa  154  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  56.1 
 
 
123 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  54.47 
 
 
123 aa  152  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  54.47 
 
 
123 aa  150  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  55.74 
 
 
125 aa  150  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  54.92 
 
 
125 aa  150  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  56.2 
 
 
123 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  57.39 
 
 
126 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  56.56 
 
 
131 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  57.38 
 
 
132 aa  148  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  58.93 
 
 
153 aa  149  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  57.38 
 
 
132 aa  148  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  56.56 
 
 
131 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  55.56 
 
 
127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  56.03 
 
 
120 aa  143  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  48.8 
 
 
125 aa  143  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  53.28 
 
 
125 aa  142  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  54.1 
 
 
124 aa  143  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  54.84 
 
 
124 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  48.8 
 
 
154 aa  142  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  51.72 
 
 
123 aa  142  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  54.78 
 
 
125 aa  141  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  54.84 
 
 
124 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  54.84 
 
 
124 aa  140  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  54.84 
 
 
124 aa  140  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  52.1 
 
 
121 aa  140  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  52.89 
 
 
131 aa  139  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  58.4 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  52.1 
 
 
120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  51.3 
 
 
117 aa  138  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  58.72 
 
 
122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  54.24 
 
 
149 aa  136  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  52.1 
 
 
130 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  52.73 
 
 
123 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  47.54 
 
 
122 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  52.14 
 
 
123 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  64.22 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  54.46 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  49.14 
 
 
123 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  49.14 
 
 
123 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  58.68 
 
 
121 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  58.68 
 
 
121 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  58.68 
 
 
121 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  59.63 
 
 
120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  52.94 
 
 
122 aa  127  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  46.92 
 
 
125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  48.18 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  52.03 
 
 
123 aa  121  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  41.86 
 
 
124 aa  103  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  46.08 
 
 
124 aa  102  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  38.26 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  41.82 
 
 
113 aa  98.6  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  37.38 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  37.38 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  36.21 
 
 
121 aa  97.1  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  37.39 
 
 
120 aa  96.7  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  36.61 
 
 
124 aa  96.7  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  44.33 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  43.69 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  42.72 
 
 
140 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  42.72 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  47.52 
 
 
146 aa  90.5  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  42.72 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  47.47 
 
 
146 aa  88.6  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  41.75 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  46.46 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  40.78 
 
 
170 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  40.78 
 
 
170 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  40.78 
 
 
170 aa  87  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  41 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  39.05 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  37.86 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  44.44 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  46.32 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2251  Thioredoxin domain protein  37.5 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.32893  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  39.05 
 
 
178 aa  84  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  44.44 
 
 
162 aa  83.6  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  42.11 
 
 
146 aa  83.6  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  43.96 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  36.96 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  39.81 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  38.83 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  41.41 
 
 
140 aa  82  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  40.82 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3727  Thioredoxin domain  40 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  42.7 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  42.7 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  42.7 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>