More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0052 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  100 
 
 
135 aa  274  3e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  68.18 
 
 
138 aa  196  6e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  48.87 
 
 
139 aa  142  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  53.47 
 
 
105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  43.1 
 
 
133 aa  115  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  50.5 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  52.48 
 
 
104 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  36.92 
 
 
154 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  52.48 
 
 
104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  51.49 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  50.5 
 
 
104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  50.5 
 
 
104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0097  thioredoxin  37.9 
 
 
149 aa  106  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1670  thioredoxin  40.77 
 
 
131 aa  106  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  47.42 
 
 
112 aa  106  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  50 
 
 
104 aa  105  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  43.3 
 
 
114 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  44.12 
 
 
105 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  47.52 
 
 
104 aa  104  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  54.35 
 
 
108 aa  104  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0227  thioredoxin  39.06 
 
 
138 aa  103  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  46.53 
 
 
115 aa  103  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  50.54 
 
 
110 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  50.56 
 
 
109 aa  103  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  41.18 
 
 
110 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  46.81 
 
 
109 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  45.71 
 
 
108 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  43.56 
 
 
133 aa  101  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  47.06 
 
 
110 aa  101  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  47.19 
 
 
114 aa  101  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  47.52 
 
 
105 aa  101  4e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  45.74 
 
 
109 aa  100  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  45.83 
 
 
110 aa  100  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  46.15 
 
 
108 aa  100  8e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  44.12 
 
 
105 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  41.51 
 
 
109 aa  99.4  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  43.69 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  48.86 
 
 
223 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  45.92 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  46.81 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  43.14 
 
 
109 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  42.57 
 
 
106 aa  98.2  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  44.09 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  40.78 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  45.83 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  44.55 
 
 
106 aa  97.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  42.31 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  46.32 
 
 
109 aa  97.1  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  47.78 
 
 
106 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  40.59 
 
 
106 aa  97.1  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  46.74 
 
 
104 aa  96.7  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  45.45 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  45.45 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  44.44 
 
 
178 aa  96.7  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  39.82 
 
 
125 aa  96.7  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  39.6 
 
 
126 aa  95.5  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  41.35 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  38.32 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1614  thioredoxin  33.86 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  43.01 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  41.58 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  37.96 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  39.6 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  41.58 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  41.58 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  41.58 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  42.86 
 
 
110 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  41.49 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  41.49 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  41.3 
 
 
123 aa  94.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  45.45 
 
 
290 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  31.58 
 
 
146 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  39.05 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  42.31 
 
 
286 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  39.42 
 
 
109 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  44.57 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0588  thioredoxin  36.22 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.99153  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  49.41 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  48.24 
 
 
107 aa  94  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  42.39 
 
 
125 aa  94  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  45.45 
 
 
170 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  41.51 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  41.35 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  50.65 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  40.4 
 
 
109 aa  94  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  45.45 
 
 
170 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  44.44 
 
 
140 aa  94  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  43.43 
 
 
140 aa  93.6  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  36.11 
 
 
109 aa  93.6  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  45.45 
 
 
170 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  45.45 
 
 
170 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  40.43 
 
 
107 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  40.2 
 
 
105 aa  93.6  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  45.05 
 
 
109 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  37.61 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  36.11 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  44.12 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  43.3 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  36.11 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  36.11 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>