More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4319 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  100 
 
 		 119 aa  238  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  71.43 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  66.39 
 
 		 120 aa  169  7.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  62.39 
 
 		 119 aa  147  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  58.93 
 
 		 147 aa  130  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  54.37 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  51.52 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  56.63 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  42.72 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  43.69 
 
 		 269 aa  98.6  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  53.66 
 
 		 280 aa  98.2  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  56.1 
 
 		 280 aa  97.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  54.22 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  49.44 
 
 		 272 aa  97.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  51.76 
 
 		 109 aa  97.1  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  41.75 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  96.7  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  43.69 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  43.69 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  41.75 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  43.69 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  50.59 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  50 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  44.09 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  43.69 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  43.69 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  43.69 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  39.81 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  49.41 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  52.38 
 
 		 302 aa  95.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  51.22 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  42.42 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  42.42 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  41.75 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  40.82 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  42.42 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  50.59 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  39.45 
 
 		 146 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  51.19 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  41.75 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  46.6 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  40.78 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  50.59 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  40.19 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  42.72 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  40.95 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  44.44 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  42.16 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  38.53 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  47.67 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  40.4 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  42.72 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  40.19 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  50 
 
 		 302 aa  92  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  43.75 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  42.42 
 
 		 238 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  53.66 
 
 		 282 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  41.41 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  53.66 
 
 		 282 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  42.42 
 
 		 104 aa  90.9  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  42 
 
 		 108 aa  90.5  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  45.88 
 
 		 109 aa  90.9  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  41.75 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>