More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2519 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2519  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 244 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4649  rhodanese domain-containing protein  37.99 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  30.4 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  33.7 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  34.38 
 
 		 98 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  34.69 
 
 		 106 aa  77.4  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  44.32 
 
 		 112 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  38.89 
 
 		 109 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  29.79 
 
 		 98 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  40.22 
 
 		 107 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  31.91 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  39.18 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  38.89 
 
 		 109 aa  72  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  27.59 
 
 		 127 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  37.08 
 
 		 107 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  36.25 
 
 		 107 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  36.08 
 
 		 108 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  40.23 
 
 		 107 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  36.08 
 
 		 108 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  37.5 
 
 		 110 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  37.93 
 
 		 107 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  35.56 
 
 		 107 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  35.56 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  35.05 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  38.04 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  34.44 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  37.35 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  35.56 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  34.78 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  35.56 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  29.89 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  35.56 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  36.96 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  35.56 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  35.56 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  36.96 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  36.46 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  36.96 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  35.56 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  35.56 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  34.78 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  32.32 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  34.34 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  37.08 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  35.56 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  29 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  28 
 
 		 106 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  30.93 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  29.03 
 
 		 107 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  36.78 
 
 		 106 aa  68.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  34.44 
 
 		 146 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  34.78 
 
 		 106 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  31.11 
 
 		 110 aa  67.8  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  35.56 
 
 		 109 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  36.96 
 
 		 109 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  36.96 
 
 		 109 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  28.72 
 
 		 107 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  34.44 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  34.44 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  32.95 
 
 		 107 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  36.96 
 
 		 109 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  34.44 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  34.48 
 
 		 107 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  33.7 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  34.44 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  36.96 
 
 		 109 aa  67.4  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  36.96 
 
 		 109 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  36.96 
 
 		 109 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  36.96 
 
 		 109 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  38.75 
 
 		 106 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  36.56 
 
 		 109 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  34.44 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  34.44 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  31.63 
 
 		 106 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  33.7 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  36.96 
 
 		 109 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  34.44 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  34.44 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  36.96 
 
 		 109 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  36.96 
 
 		 109 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  36.96 
 
 		 109 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  36.96 
 
 		 109 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  36.96 
 
 		 109 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  36.96 
 
 		 109 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  34.94 
 
 		 107 aa  67  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  34.74 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  29.76 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  34.94 
 
 		 107 aa  67  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  33.7 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  34.74 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  34.74 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  34.44 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  35.96 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>