More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6898 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2519  Rhodanese domain protein  33.7 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  34.39 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4649  rhodanese domain-containing protein  29.91 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  40.68 
 
 		 125 aa  88.6  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  40.57 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  36.79 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  42.35 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  35.83 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06440  lipoprotein, putative  39.81 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  44.05 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  38.39 
 
 		 148 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  36.75 
 
 		 123 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  43.18 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  42.53 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  32.17 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  39.33 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  38.78 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.64 
 
 		 478 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 		 685 aa  69.7  0.00000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  33.58 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  41.33 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  41.18 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3736  Rhodanese domain protein  32.9 
 
 		 346 aa  68.6  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571798  normal  0.0306844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  41.1 
 
 		 120 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  41.38 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  34.88 
 
 		 108 aa  67  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  32.56 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  32.48 
 
 		 141 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  36.75 
 
 		 280 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  38.82 
 
 		 137 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 108 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  36.89 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  34.58 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0454  rhodanese-like domain-containing protein  33.65 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.622343  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  38.37 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  40 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  37.93 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  38.37 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  38.37 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  36.25 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 		 480 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  41.58 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  44.44 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01051  hypothetical protein  36.44 
 
 		 350 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2591  Rhodanese domain protein  36.44 
 
 		 350 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894148  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 279 aa  65.1  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  37 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1177  hypothetical protein  36.44 
 
 		 350 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01059  hypothetical protein  36.44 
 
 		 350 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2545  hypothetical protein  36.44 
 
 		 350 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2075  hypothetical protein  36.44 
 
 		 350 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  0.562441 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1178  hypothetical protein  36.44 
 
 		 350 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.762117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1434  hypothetical protein  36.44 
 
 		 350 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.782992  normal  0.247689 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  39.18 
 
 		 288 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  34.78 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 		 150 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0417  Rhodanese domain protein  33.66 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.678691 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  35.92 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  44.29 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2404  protein of unknown function DUF156  33.98 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  40.96 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  36.67 
 
 		 103 aa  64.3  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  63.9  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  40.96 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  40.96 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  40.58 
 
 		 125 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  34.29 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6383  thioredoxin  43.42 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  33.98 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  30.33 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  27.83 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1574  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1223  hypothetical protein  35.59 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  38.96 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  34.29 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2217  hypothetical protein  35.59 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.598434 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  36.14 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  30.16 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  39.13 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  32.88 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  37.8 
 
 		 459 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1267  hypothetical protein  35.59 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  33.75 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  36.25 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  39.13 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2259  thioredoxin  35.35 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  37.84 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  37.38 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>