More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4281 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  100 
 
 		 104 aa  211  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  49 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  47.06 
 
 		 108 aa  106  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  47.06 
 
 		 108 aa  106  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  47.06 
 
 		 108 aa  106  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  104  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  45.1 
 
 		 133 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  47.87 
 
 		 110 aa  103  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  47 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  46.32 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  48.42 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  47.06 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  44.12 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  44.12 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  44.66 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  44.76 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  42.16 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  46.32 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  47.37 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  46.6 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  43.56 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  47.92 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  44.68 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  45.54 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  47.92 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  44.12 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  43.14 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  44.12 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  45.54 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  47.83 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  46.53 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  41.58 
 
 		 109 aa  100  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  43.56 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  46.08 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  40.2 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  45.54 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  43.69 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  47.31 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  45.74 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  45.1 
 
 		 108 aa  100  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  100  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  45.74 
 
 		 108 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  43.14 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  43.14 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  43.14 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  43.14 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  43.14 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  43.14 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  43.14 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  51.22 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  43.14 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  43.14 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  43.14 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  43.14 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  43.14 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  43.14 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  43.14 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  46.88 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  43.14 
 
 		 109 aa  99.4  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  46.32 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  42.57 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  42.16 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  42.16 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  39.6 
 
 		 109 aa  98.6  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  44.55 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  44.55 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  46.81 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  44.68 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  43.69 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  46.88 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  46.88 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  43.56 
 
 		 109 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  44.21 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  44.79 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  44.21 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  44.21 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  42.16 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  44.21 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  44.21 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  44.21 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  41.18 
 
 		 109 aa  96.7  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  42.57 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  44.21 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>