More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0894 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  100 
 
 		 102 aa  206  8e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  50.54 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  50.54 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  50.54 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  43.62 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  47.25 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  47.25 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  52.63 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  45.45 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  47.87 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  47.31 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  47.87 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  46.81 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  46.81 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  46.81 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  46.81 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  46.81 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  46.81 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  46.81 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  46.81 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  46.81 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  46.81 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  46.81 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  46.81 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  46.81 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  46.81 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  44.21 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  42.86 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  46.81 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  46.32 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  46.07 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  47.37 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  48.39 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  45.16 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  47.31 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  45.74 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  45.16 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  47.37 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  45.16 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  45.74 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  45.74 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  51.22 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  45.12 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  44.68 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  46.07 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  46.07 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  46.07 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  44.68 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  45.74 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  45.26 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  51.28 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  48.31 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  47.31 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  47.31 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  43.01 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  44.21 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  46.07 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  42.55 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  40.21 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  42.39 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  41.94 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  51.95 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  41.94 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  51.72 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  48.78 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  40 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  43.62 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  41.05 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  42.71 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  46.34 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  43.56 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  44.21 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  36.27 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  43.75 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  53.95 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  45.78 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  50 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  46.24 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  46.34 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  47.56 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  43.48 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  43.16 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  47.56 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  41.94 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  40.86 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  43.01 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  47.31 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  44.09 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>