More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0835 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  100 
 
 		 102 aa  207  3e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  57.43 
 
 		 102 aa  134  4e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  46 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  44 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  44 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  42.86 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  39.18 
 
 		 104 aa  90.9  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  44.44 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  40.59 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  49.45 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  47.25 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  43.75 
 
 		 104 aa  87.4  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  87  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  41.05 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  43.81 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  43.81 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  50 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  47.31 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  36.46 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  40 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  35.35 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  39.39 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  40.59 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  40.95 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  39.05 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  38.1 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  40.7 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  48.78 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  43.33 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  40.4 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  40.95 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  41.9 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  39.05 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  36.19 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  40.38 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  38.71 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  39.6 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  41.24 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  40.38 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  40.91 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  36.54 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  39.05 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  36.54 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  40.45 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  41.46 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  39.81 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  44.09 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  45.68 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  39.05 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  44.44 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  39.05 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  41.75 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  42.68 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  45.45 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  40 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  38.24 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  37.14 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  36.54 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  43.4 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  38.83 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  40.86 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  36.19 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  38.14 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  36.54 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  45.24 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  39.05 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  39.39 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  44.12 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  44.34 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  37.5 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  45.68 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  39.05 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  37.76 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  37.11 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  40.95 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  38.1 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  38.46 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  45 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  36.17 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  39.05 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  49.3 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  36.73 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  39.05 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  42.55 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  40.38 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  40.38 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  40.43 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  38.1 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  38.1 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  38.1 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  36.54 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  39.05 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>