More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48539 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  100 
 
 		 165 aa  338  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  48.04 
 
 		 105 aa  106  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  53.75 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  47.62 
 
 		 117 aa  99.8  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  48.89 
 
 		 104 aa  95.1  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  47.67 
 
 		 104 aa  94.7  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  50 
 
 		 104 aa  92.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  43.3 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  48.81 
 
 		 105 aa  91.3  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  47.73 
 
 		 104 aa  90.9  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  45 
 
 		 104 aa  90.5  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  45 
 
 		 104 aa  90.5  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  48.57 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  46.43 
 
 		 108 aa  88.2  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  46.15 
 
 		 109 aa  87.8  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  42.53 
 
 		 109 aa  87.8  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  48.84 
 
 		 104 aa  87.8  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37753  predicted protein  46.43 
 
 		 101 aa  87.4  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0200499  hitchhiker  0.00126408 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  45.05 
 
 		 104 aa  87  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  47.44 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  48.48 
 
 		 106 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  43.02 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  46.05 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  47.5 
 
 		 112 aa  86.3  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  46.46 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  41.86 
 
 		 114 aa  85.5  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  45.45 
 
 		 106 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  41.3 
 
 		 104 aa  85.5  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  40.24 
 
 		 104 aa  85.1  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  38.46 
 
 		 104 aa  85.1  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  47.47 
 
 		 106 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  50.68 
 
 		 107 aa  84.7  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  40.38 
 
 		 144 aa  84.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  47.87 
 
 		 109 aa  84.3  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  48.24 
 
 		 107 aa  84  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  48.24 
 
 		 107 aa  84  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  41.77 
 
 		 108 aa  84.3  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  46.51 
 
 		 107 aa  84  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  39.53 
 
 		 109 aa  84  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  43.01 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  44.05 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  36.52 
 
 		 133 aa  83.6  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  44.44 
 
 		 106 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  37.93 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  44.05 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  48.15 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  41.67 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  37.78 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  36.08 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  44.44 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  50.68 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  47.06 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  45.45 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  44.32 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  45.45 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  43.88 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  46.51 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  41.86 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  43.18 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  39.32 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  44.05 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  42.68 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  40.48 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  46.99 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  41.11 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  52.05 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  44.58 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  37.78 
 
 		 259 aa  81.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  43.37 
 
 		 330 aa  81.3  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  42.68 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  46.99 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  45.78 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  45.78 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  48.15 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  44 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  45.78 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  45.21 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  46.43 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  39.09 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  44.05 
 
 		 406 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  40 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  42.7 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  38.46 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  45.88 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  48.61 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  38.32 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 768 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  40.45 
 
 		 98 aa  80.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  44.71 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  40.45 
 
 		 102 aa  80.5  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  44.71 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  45.68 
 
 		 109 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  42.86 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  35.34 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  43.37 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  40.21 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  45.68 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  45.21 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  42.86 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  42.5 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>