More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1823 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  100 
 
 		 105 aa  222  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  46.08 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  42.57 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  44.79 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  44.68 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  42.99 
 
 		 282 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  43.56 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  38.83 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  40.59 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  40.59 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  41.12 
 
 		 282 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  43.43 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  40 
 
 		 282 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  41.12 
 
 		 282 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  41.9 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  40.57 
 
 		 301 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  38.61 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  40.95 
 
 		 282 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  40.95 
 
 		 282 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  40.95 
 
 		 282 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  40.57 
 
 		 918 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  40.95 
 
 		 282 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  40.95 
 
 		 282 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  41.75 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  41.75 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  40 
 
 		 282 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  40.95 
 
 		 282 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  41.9 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  40 
 
 		 282 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  41.18 
 
 		 280 aa  98.6  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  38.61 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  41.84 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  47.06 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  40 
 
 		 282 aa  98.2  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  39.22 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  45.12 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  41.67 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  42 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  42 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  39.42 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  42 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  44.71 
 
 		 280 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  38.46 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  41 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  38.83 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  44.83 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  49.43 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  43 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  39.6 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  40.21 
 
 		 108 aa  94.4  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  43.53 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  39.81 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  42.39 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  43.48 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  42.35 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  43 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  36.27 
 
 		 112 aa  93.6  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  42.22 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  42.39 
 
 		 108 aa  93.6  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  38.1 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  38.24 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  37.14 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  42 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  38.83 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  41.56 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  47.42 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  41.67 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  40.59 
 
 		 259 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  37.25 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  36.27 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  33.33 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  37.14 
 
 		 120 aa  92.8  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  33.33 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  40 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  38.54 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  41.75 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  41.76 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  39.05 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  36.54 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  40.21 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  42.35 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  38.24 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  37.11 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  38.3 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  41.75 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  39.42 
 
 		 302 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  41.75 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  39.8 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  37 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  38.3 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>