More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0230 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  100 
 
 		 133 aa  276  5e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  43.1 
 
 		 135 aa  115  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  44.07 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  42.02 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  52.38 
 
 		 110 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  50.5 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  49.44 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  52.27 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  47.78 
 
 		 115 aa  104  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  49.44 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  36.51 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  47.83 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  47.78 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  45.56 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  47.78 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  49.44 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0227  thioredoxin  42.15 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  45.1 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  46 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  48.31 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  40.2 
 
 		 238 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  46 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  46 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  46 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  45 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  45 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  46.67 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  46 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  48.35 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  48.35 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  48.35 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  46.74 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  47.25 
 
 		 110 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  44 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  44 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  45.56 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  47.19 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  40.19 
 
 		 286 aa  99.4  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  48.89 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  39.37 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  41 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  49.49 
 
 		 109 aa  99.4  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  48.35 
 
 		 109 aa  98.6  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  46.15 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  47.19 
 
 		 109 aa  98.6  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  43.69 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  45.45 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  41 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  47.25 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  45.1 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  43.96 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  52.27 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  98.2  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  44.12 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  48.86 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  38.83 
 
 		 259 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  48.86 
 
 		 109 aa  98.2  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  48.35 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  43.96 
 
 		 110 aa  97.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  45.05 
 
 		 109 aa  97.1  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  46.15 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  48.89 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  45.45 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  97.1  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  46.15 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  45.05 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  47.25 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  38.02 
 
 		 124 aa  97.1  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  48.86 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  50 
 
 		 105 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  43 
 
 		 107 aa  96.7  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  40 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  46.15 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  44.57 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  36.44 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  46.15 
 
 		 109 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  48.98 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  48.86 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  36.44 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  50 
 
 		 105 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  48.86 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  47.13 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2157  thioredoxin  43.48 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.336694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  43.18 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  47.13 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  39 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  44.32 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  41 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  39.42 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  46.07 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  39 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  39 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  39 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>