More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl178 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  100 
 
 
102 aa  209  1e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  57.43 
 
 
102 aa  134  4e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  38.78 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  41.49 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  39.77 
 
 
105 aa  84  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  40.95 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  48.81 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  48.81 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  48.81 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  41.49 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  42.57 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  43.48 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  45.35 
 
 
102 aa  80.5  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  44.87 
 
 
108 aa  80.1  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  39.77 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  43.56 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  44.87 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  37.76 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  48.68 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  33.33 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  46.91 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  42.86 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  52.24 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  41.41 
 
 
108 aa  77  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  40 
 
 
104 aa  77  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  40.22 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  42.86 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  43.68 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  45.78 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  41.3 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  40.45 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  45.95 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  42.55 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  42.55 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  42.55 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  44.71 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  44.71 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  34.41 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  40 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  42.86 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  35.42 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  37.5 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  38.46 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  41.76 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  42.35 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  38.46 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  44.87 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  44.58 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  40 
 
 
117 aa  73.9  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  42.86 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  38.46 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  45.95 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  44.57 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  42.05 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  37.5 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  38.46 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  43.21 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  41.18 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  36.45 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  44.57 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  35.58 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  38.27 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  38.46 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  42.17 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  38.04 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  38.46 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  38.46 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  39 
 
 
108 aa  73.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  37.5 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  45.24 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  43.75 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  39.56 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  38.46 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  46.75 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  45.57 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  41.67 
 
 
98 aa  72  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  37.5 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  39.36 
 
 
105 aa  72  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  41.58 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  43.59 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  44.16 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  36.89 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  35.58 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  35.58 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  35.58 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  35.58 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  35.58 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  34.95 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  43.01 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  35.58 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  35.58 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  35.58 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  35.58 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  43.37 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  35.58 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  44.87 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  38.78 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  35.58 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  38.04 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>