More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2794 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2794  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.718794  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  31.97 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  36.45 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  30.3 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  39.42 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  27.66 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  33.82 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  31.53 
 
 		 169 aa  57  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  32.58 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  36.63 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  33.91 
 
 		 480 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  31.76 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  36.25 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  31.52 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  37.93 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  28.42 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1212  rhodanese domain-containing protein  32.46 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  32.59 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  32.59 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  27.36 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  38.04 
 
 		 711 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  35.14 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  32.74 
 
 		 480 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  30.11 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  28.42 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  32.73 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  31.48 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  32.71 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  28.3 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0273  rhodanese domain-containing protein  29.51 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  25.71 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.79 
 
 		 478 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.7 
 
 		 478 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.58 
 
 		 390 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  36.14 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  35.79 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  26.47 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 282 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  33 
 
 		 263 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  29.91 
 
 		 109 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  36.59 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  26.32 
 
 		 150 aa  50.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.29 
 
 		 395 aa  50.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  29.36 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  25.24 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  27.08 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.29 
 
 		 386 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  32.69 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  34.07 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  27.07 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  32.61 
 
 		 484 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.61 
 
 		 478 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.61 
 
 		 478 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  32.61 
 
 		 478 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  32.61 
 
 		 484 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  37.62 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  27.56 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  27.62 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  25.81 
 
 		 380 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  37.65 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  28.57 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  27.62 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.08 
 
 		 390 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  26.04 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  23.74 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  28.07 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  28.32 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0382  Rhodanese domain protein  30.97 
 
 		 274 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0199253  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  27.94 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.33 
 
 		 400 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  36.46 
 
 		 390 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  34.74 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.78 
 
 		 562 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  30.19 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.33 
 
 		 400 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  34.74 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  28.09 
 
 		 229 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  25 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  32.23 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.33 
 
 		 400 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 272 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  31.43 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  27.96 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  35.23 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  29.63 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  29.63 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  29.63 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  30.36 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  29.63 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  29.63 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  30.1 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>