More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2006 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01726  predicted thiosulfate sulfur transferase  99.3 
 
 		 435 aa  877    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.382784  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1885  Rhodanese domain protein  99.06 
 
 		 435 aa  872    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01714  hypothetical protein  99.3 
 
 		 435 aa  877    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.526406  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1875  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 435 aa  882    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1841  rhodanese-like domain-containing protein  98.59 
 
 		 435 aa  870    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1690  rhodanese domain-containing protein  79.16 
 
 		 435 aa  694    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2006  rhodanese-like domain protein  100 
 
 		 428 aa  882    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1980  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 		 435 aa  882    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0372408  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2476  rhodanese-like domain protein  98.59 
 
 		 435 aa  866    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1433  rhodanese-like domain-containing protein  98.83 
 
 		 435 aa  874    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.587223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1149  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 		 457 aa  296  4e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1308  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 430 aa  292  9e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1376  rhodanese-like protein  54.75 
 
 		 282 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0566917 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1124  putative thiosulfate sulfurtransferase  34.7 
 
 		 451 aa  240  4e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.030225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1308  putative thiosulfate sulfurtransferase  34.08 
 
 		 451 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.419981  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2110  Rhodanese domain protein  39.62 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  29.83 
 
 		 291 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  31.48 
 
 		 288 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.51 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  28.57 
 
 		 285 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  30.17 
 
 		 288 aa  99.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.47 
 
 		 283 aa  97.1  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  31.66 
 
 		 284 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  29.77 
 
 		 293 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  27.12 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 295 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2873  Rhodanese domain protein  27.13 
 
 		 327 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  28.4 
 
 		 286 aa  93.6  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  28.9 
 
 		 287 aa  93.2  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  28.91 
 
 		 278 aa  93.2  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2817  Rhodanese domain protein  24.84 
 
 		 325 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.84 
 
 		 287 aa  92  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  30.6 
 
 		 284 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  27.95 
 
 		 286 aa  90.5  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.1 
 
 		 285 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  29.71 
 
 		 284 aa  89.7  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  29.33 
 
 		 295 aa  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  29.84 
 
 		 291 aa  89.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  29.96 
 
 		 287 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28 
 
 		 284 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  29.53 
 
 		 297 aa  88.6  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  29.43 
 
 		 321 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  29.45 
 
 		 292 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  27.61 
 
 		 291 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  28.11 
 
 		 280 aa  87.8  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4532  rhodanese-like protein  27.48 
 
 		 298 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  26.99 
 
 		 283 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  29.76 
 
 		 277 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  29.76 
 
 		 277 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.57 
 
 		 291 aa  87.4  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  29.76 
 
 		 277 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  26.71 
 
 		 281 aa  86.7  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.86 
 
 		 282 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  26.44 
 
 		 321 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  27.86 
 
 		 282 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  26.35 
 
 		 320 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 		 283 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4550  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  28.91 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  26.44 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  27.48 
 
 		 282 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  27.48 
 
 		 285 aa  86.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.57 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  29.87 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.27 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  26.38 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  29 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  27.27 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  26.48 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  29.13 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  27.41 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  29.66 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  28.08 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  29.28 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  28.03 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  30.08 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7246  rhodanese-related sulfurtransferase  30.08 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0149117  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  29.07 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  27.27 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  26.95 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  26.33 
 
 		 284 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  27.31 
 
 		 281 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  27.12 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  27.12 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  27.4 
 
 		 277 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  27.12 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.19 
 
 		 289 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  28.14 
 
 		 312 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  29.96 
 
 		 277 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  27.1 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  24.41 
 
 		 282 aa  82.4  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  24.81 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  28.21 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  25.9 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  29.96 
 
 		 277 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  25.58 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  27.57 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4079  rhodanese-like protein  27.88 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.361854 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  29.96 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  26.71 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>