More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1149 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1149  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 457 aa  954    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1308  Rhodanese domain protein  72.2 
 
 		 430 aa  663    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1875  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 		 435 aa  296  4e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1980  rhodanese-like domain-containing protein  37.76 
 
 		 435 aa  296  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0372408  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2006  rhodanese-like domain protein  37.76 
 
 		 428 aa  296  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1433  rhodanese-like domain-containing protein  37.76 
 
 		 435 aa  296  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.587223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2476  rhodanese-like domain protein  37.76 
 
 		 435 aa  296  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01726  predicted thiosulfate sulfur transferase  37.53 
 
 		 435 aa  295  9e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.382784  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01714  hypothetical protein  37.53 
 
 		 435 aa  295  9e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.526406  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1885  Rhodanese domain protein  37.53 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1690  rhodanese domain-containing protein  38.59 
 
 		 435 aa  294  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1841  rhodanese-like domain-containing protein  37.38 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1308  putative thiosulfate sulfurtransferase  36.08 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.419981  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1124  putative thiosulfate sulfurtransferase  36.08 
 
 		 451 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.030225  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2110  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 		 324 aa  182  8.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1376  rhodanese-like protein  41.25 
 
 		 282 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0566917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  32 
 
 		 293 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  29.49 
 
 		 288 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  30.28 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  30.58 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  31.21 
 
 		 291 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  27.65 
 
 		 283 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4532  rhodanese-like protein  29.89 
 
 		 298 aa  96.7  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 		 297 aa  96.3  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.16 
 
 		 627 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  28.57 
 
 		 285 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  28.06 
 
 		 320 aa  93.6  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  31.27 
 
 		 289 aa  92.8  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  27.24 
 
 		 300 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  31.33 
 
 		 290 aa  92.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  28.01 
 
 		 286 aa  92  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  29.32 
 
 		 281 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6245  rhodanese domain-containing protein  28.29 
 
 		 295 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  30.88 
 
 		 272 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  27.07 
 
 		 277 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  28.95 
 
 		 285 aa  90.9  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  29.32 
 
 		 281 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  30.71 
 
 		 291 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  26.14 
 
 		 321 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  27.21 
 
 		 281 aa  88.6  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  29.97 
 
 		 285 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  26.47 
 
 		 288 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  26.14 
 
 		 321 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  29.26 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  29.08 
 
 		 297 aa  87.8  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  28.36 
 
 		 287 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  29.62 
 
 		 283 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  29.7 
 
 		 280 aa  87.8  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  30.37 
 
 		 296 aa  87.8  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  26.77 
 
 		 282 aa  87.4  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  27.78 
 
 		 270 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 291 aa  87  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  27.78 
 
 		 305 aa  86.7  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2873  Rhodanese domain protein  24.83 
 
 		 327 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  26.39 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0089  Rhodanese domain protein  28.48 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000095367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4079  rhodanese-like protein  26.2 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.361854 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  28.94 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.3 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2817  Rhodanese domain protein  25.66 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  27.88 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  28.37 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  27.99 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  28.47 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  29.13 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  29.09 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  29.09 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  24.92 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  29.09 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  29.09 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  29.09 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  29.09 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.09 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.09 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4507  rhodanese-like protein  29.08 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  27.72 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  27.08 
 
 		 284 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  29.26 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  28.47 
 
 		 280 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  24.36 
 
 		 285 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  28.27 
 
 		 284 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  28.78 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  29.25 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4783  rhodanese domain-containing protein  29.97 
 
 		 269 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  28.71 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0689  rhodanese domain-containing protein  27.84 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  27.9 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4907  rhodanese domain protein  30.43 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  26.74 
 
 		 687 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  29.62 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  28.12 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  28.52 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  26.9 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4960  rhodanese domain-containing protein  29.93 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  26.91 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  26.49 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  28.08 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  26.75 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  26.75 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>