167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1663 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  100 
 
 		 2449 aa  4962    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1655  hypothetical protein  33.83 
 
 		 1425 aa  328  6e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1725  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1993 aa  295  6e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0942  adhesion exoprotein  27.2 
 
 		 2833 aa  226  3e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0410  adhesion exoprotein  26.24 
 
 		 2457 aa  180  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  44.3 
 
 		 2397 aa  111  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  38.21 
 
 		 3409 aa  107  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0046  adhesion exoprotein  23.92 
 
 		 985 aa  103  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8097  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like protein  38.5 
 
 		 521 aa  99.8  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  39.56 
 
 		 3521 aa  99.8  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10770  MucBP-like protein  35.43 
 
 		 721 aa  97.4  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.712017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0045  adhesion exoprotein  27.11 
 
 		 3692 aa  97.1  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  31.45 
 
 		 1859 aa  96.3  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  40.1 
 
 		 3471 aa  89.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  40.1 
 
 		 3472 aa  89.7  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  48.63 
 
 		 497 aa  89.4  9e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  39.16 
 
 		 1049 aa  87  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0143  adhesion exoprotein  27.3 
 
 		 2823 aa  81.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5097  hypothetical protein  26.58 
 
 		 537 aa  80.9  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00280261  normal  0.375378 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0044  adhesion exoprotein  23.19 
 
 		 873 aa  81.3  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0409  hypothetical protein  27.13 
 
 		 527 aa  80.1  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9251  hypothetical protein  27.34 
 
 		 651 aa  80.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0576  hypothetical protein  32.99 
 
 		 996 aa  78.2  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  30.97 
 
 		 723 aa  77.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.01 
 
 		 721 aa  77.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  31.79 
 
 		 605 aa  73.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  30.32 
 
 		 717 aa  73.6  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0374  hypothetical protein  31.72 
 
 		 738 aa  72.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0650297  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0943  adhesion exoprotein  37.1 
 
 		 979 aa  71.6  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  43.02 
 
 		 2313 aa  71.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0545  hypothetical protein  36.94 
 
 		 570 aa  71.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.8 
 
 		 751 aa  70.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0573  metal dependent phosphohydrolase  32.41 
 
 		 736 aa  69.7  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334639  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8081  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.32 
 
 		 769 aa  68.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.887421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2032  ribonuclease  41.25 
 
 		 1142 aa  67.8  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.390229  normal  0.144876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  26.84 
 
 		 718 aa  67.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1328  hypothetical protein  26.26 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  29.63 
 
 		 522 aa  65.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  35.43 
 
 		 2179 aa  65.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6783  hypothetical protein  32.16 
 
 		 539 aa  64.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  35.43 
 
 		 2272 aa  63.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3121  mucin 17-like protein  32.07 
 
 		 1788 aa  63.9  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2879  hypothetical protein  31.76 
 
 		 632 aa  62.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  50.56 
 
 		 848 aa  62.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1467  hypothetical protein  34.53 
 
 		 364 aa  62.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4888  hypothetical protein  21 
 
 		 321 aa  62  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  28.95 
 
 		 490 aa  60.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1274  hypothetical protein  31.93 
 
 		 428 aa  58.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0349989  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  26.21 
 
 		 1128 aa  58.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1516  hypothetical protein  30.41 
 
 		 367 aa  58.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0503822  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  33.16 
 
 		 979 aa  57  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  26.22 
 
 		 784 aa  57.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  56.1 
 
 		 1594 aa  57.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1913  hypothetical protein  31.46 
 
 		 337 aa  57.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00733934  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4228  hypothetical protein  36.49 
 
 		 653 aa  57  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  30.06 
 
 		 537 aa  56.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  30.28 
 
 		 787 aa  56.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28970  hypothetical protein  33.72 
 
 		 419 aa  56.6  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35840  hypothetical protein  42.19 
 
 		 606 aa  56.6  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1596  hypothetical protein  30.91 
 
 		 562 aa  55.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0741  hypothetical protein  35.53 
 
 		 515 aa  55.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1911  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3489  diacylglycerol kinase catalytic region  25.23 
 
 		 541 aa  55.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  30.3 
 
 		 510 aa  54.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0178  hypothetical protein  29.94 
 
 		 360 aa  54.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000828207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.93 
 
 		 473 aa  54.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6286  hypothetical protein  29.03 
 
 		 245 aa  54.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0767  hypothetical protein  30.94 
 
 		 321 aa  55.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  24.16 
 
 		 586 aa  54.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  30.88 
 
 		 394 aa  53.9  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  31.07 
 
 		 746 aa  53.5  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2845  excinuclease ABC subunit C  25.42 
 
 		 762 aa  53.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  28.97 
 
 		 542 aa  53.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4694  Zinc finger-domain-containing protein  26.94 
 
 		 451 aa  53.5  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3041  hypothetical protein  28.66 
 
 		 382 aa  53.5  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1259  YSIRK Gram-positive signal peptide  35.35 
 
 		 328 aa  53.1  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.076162  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2814  Extensin family protein  30.71 
 
 		 338 aa  53.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52695  normal  0.0111316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0854  hypothetical protein  23.35 
 
 		 500 aa  53.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.939833 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4037  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.4 
 
 		 513 aa  52.8  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8202  hypothetical protein  27.41 
 
 		 483 aa  52.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565701  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  28.22 
 
 		 1088 aa  52.8  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08900  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  26.9 
 
 		 625 aa  52.8  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.206228  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23860  hypothetical protein  24.72 
 
 		 340 aa  52.8  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 495 aa  52.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  32.89 
 
 		 248 aa  52.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0939  adhesion exoprotein  24.12 
 
 		 615 aa  52.4  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000746139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1646  flagellar hook-length control protein  28.12 
 
 		 589 aa  52  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.925777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6555  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 413 aa  52.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2684  hypothetical protein  23.85 
 
 		 524 aa  52  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0188967  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1075  hypothetical protein  31.3 
 
 		 501 aa  52  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0390416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  24.14 
 
 		 324 aa  52  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00830  esterase/lipase  30.83 
 
 		 454 aa  51.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0670  hypothetical protein  30.68 
 
 		 257 aa  51.6  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564115  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2176  restriction endonuclease  30.23 
 
 		 669 aa  51.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0633  hypothetical protein  25 
 
 		 478 aa  51.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0826674  normal  0.59039 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  34.74 
 
 		 1198 aa  51.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0157  hypothetical protein  27.65 
 
 		 751 aa  51.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.77 
 
 		 1888 aa  50.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  26.62 
 
 		 420 aa  50.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4625  hypothetical protein  26.09 
 
 		 752 aa  50.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3636  hypothetical protein  22.63 
 
 		 262 aa  50.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>