More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2845 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2175  excinuclease ABC subunit C  59.44 
 
 		 688 aa  829    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1014  excinuclease ABC subunit C  54.64 
 
 		 700 aa  761    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00594805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0581  excinuclease ABC subunit C  51.83 
 
 		 687 aa  668    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9728  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2845  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 762 aa  1516    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  56.67 
 
 		 636 aa  372  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1391  excinuclease ABC, C subunit  53.4 
 
 		 605 aa  340  8e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  49.07 
 
 		 612 aa  295  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  31.27 
 
 		 705 aa  280  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0815  excinuclease ABC, C subunit  28.2 
 
 		 780 aa  278  3e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  30.51 
 
 		 677 aa  276  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  30.59 
 
 		 674 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0663  excinuclease ABC subunit C  30.46 
 
 		 681 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.912465  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1143  excinuclease ABC subunit C  30.46 
 
 		 681 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232911  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0428  excinuclease ABC subunit C  28.38 
 
 		 746 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  27.17 
 
 		 652 aa  266  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1101  excinuclease ABC subunit C  30.54 
 
 		 682 aa  265  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2410  excinuclease ABC subunit C  30.54 
 
 		 673 aa  264  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308713  hitchhiker  0.000953685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  46.5 
 
 		 677 aa  264  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  41.8 
 
 		 626 aa  264  4.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1071  excinuclease ABC subunit C  31.39 
 
 		 654 aa  264  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000538512  normal  0.216036 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  30.19 
 
 		 676 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  30.19 
 
 		 676 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  30.19 
 
 		 676 aa  263  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  44.38 
 
 		 707 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1739  excinuclease ABC subunit C  29.41 
 
 		 742 aa  258  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00965022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  44.34 
 
 		 614 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  41.18 
 
 		 591 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  43.44 
 
 		 707 aa  254  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  43.12 
 
 		 707 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  43.17 
 
 		 716 aa  251  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  42.02 
 
 		 649 aa  250  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  41.12 
 
 		 641 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  42.04 
 
 		 613 aa  248  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  42.04 
 
 		 604 aa  248  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  43.61 
 
 		 610 aa  248  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  43.61 
 
 		 610 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  42.43 
 
 		 689 aa  247  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  42.24 
 
 		 610 aa  247  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3071  excinuclease ABC subunit C  28.99 
 
 		 666 aa  247  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  42.24 
 
 		 610 aa  247  6e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  42.24 
 
 		 610 aa  247  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  43.61 
 
 		 610 aa  247  6.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  42.24 
 
 		 610 aa  247  6.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  42.44 
 
 		 610 aa  246  8e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1932  excinuclease ABC subunit C  29.53 
 
 		 692 aa  246  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0596454 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  42.36 
 
 		 614 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  37.69 
 
 		 624 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  42.07 
 
 		 610 aa  244  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  34.65 
 
 		 615 aa  243  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  36.2 
 
 		 625 aa  243  7.999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  43.17 
 
 		 617 aa  243  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  43.04 
 
 		 608 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  42.72 
 
 		 608 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  43.28 
 
 		 610 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  38.18 
 
 		 608 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  40.99 
 
 		 610 aa  241  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  43.28 
 
 		 610 aa  241  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  42.95 
 
 		 610 aa  240  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  42.72 
 
 		 613 aa  240  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  40.8 
 
 		 623 aa  240  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  42.95 
 
 		 610 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  39.18 
 
 		 591 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  38.29 
 
 		 607 aa  239  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  42.95 
 
 		 610 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1276  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 609 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00138903  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1334  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 609 aa  239  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000285239  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  41.3 
 
 		 607 aa  238  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  29.75 
 
 		 658 aa  237  5.0000000000000005e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  44.44 
 
 		 588 aa  236  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.51 
 
 		 613 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  39.5 
 
 		 590 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2700  excinuclease ABC subunit C  28.76 
 
 		 685 aa  236  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  38.7 
 
 		 598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  41.51 
 
 		 653 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  40.06 
 
 		 636 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  39.62 
 
 		 594 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  39.62 
 
 		 594 aa  235  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  39.62 
 
 		 594 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  39.62 
 
 		 594 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  39.62 
 
 		 594 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  43.35 
 
 		 607 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  40.75 
 
 		 623 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1451  excinuclease ABC subunit C  40.37 
 
 		 610 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  40.75 
 
 		 623 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  39.62 
 
 		 594 aa  234  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  39.62 
 
 		 594 aa  234  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  42.02 
 
 		 604 aa  234  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  40.2 
 
 		 617 aa  233  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  39.31 
 
 		 594 aa  232  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  40.44 
 
 		 610 aa  232  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  43.67 
 
 		 607 aa  231  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  39.31 
 
 		 594 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  44.01 
 
 		 607 aa  231  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  38.54 
 
 		 635 aa  231  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  41.24 
 
 		 588 aa  231  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2244  excinuclease ABC subunit C  28.78 
 
 		 671 aa  230  7e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208869  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  41.64 
 
 		 620 aa  230  8e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  40.5 
 
 		 607 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1595  excinuclease ABC subunit C  41.39 
 
 		 610 aa  229  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  38.81 
 
 		 607 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>