More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3961 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  57.5 
 
 		 613 aa  724    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  60.91 
 
 		 614 aa  769    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  64.52 
 
 		 636 aa  819    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 623 aa  1272    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  98.23 
 
 		 649 aa  1244    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  56.49 
 
 		 617 aa  709    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  52.93 
 
 		 604 aa  616  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  51.16 
 
 		 612 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  42.37 
 
 		 716 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  41.65 
 
 		 677 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  41.07 
 
 		 624 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  40.76 
 
 		 707 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  42.16 
 
 		 689 aa  450  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  40.85 
 
 		 707 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  40.85 
 
 		 707 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  40.81 
 
 		 607 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  40.98 
 
 		 607 aa  438  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  39.81 
 
 		 607 aa  428  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  40.93 
 
 		 588 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  40.03 
 
 		 607 aa  422  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  40.39 
 
 		 613 aa  424  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  40.57 
 
 		 613 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  38.85 
 
 		 641 aa  419  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  40.3 
 
 		 599 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  40.64 
 
 		 614 aa  415  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  38.91 
 
 		 685 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  39.3 
 
 		 615 aa  411  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  39.97 
 
 		 623 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  41.26 
 
 		 626 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  39.97 
 
 		 623 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  39.54 
 
 		 669 aa  405  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  39.16 
 
 		 623 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  39 
 
 		 653 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  38.24 
 
 		 613 aa  402  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 613 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  37.69 
 
 		 610 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  40.39 
 
 		 631 aa  398  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  37.76 
 
 		 620 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  37.24 
 
 		 620 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  38.86 
 
 		 665 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  39.67 
 
 		 631 aa  395  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  37.24 
 
 		 604 aa  395  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  39.31 
 
 		 611 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  40.1 
 
 		 622 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  37.35 
 
 		 626 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  37.07 
 
 		 598 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  36.81 
 
 		 625 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  38.4 
 
 		 708 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  35.63 
 
 		 601 aa  391  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  39.55 
 
 		 636 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  38.3 
 
 		 635 aa  388  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  37.33 
 
 		 617 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2312  excinuclease ABC subunit C  39.71 
 
 		 623 aa  388  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0420  excinuclease ABC subunit C  40.13 
 
 		 620 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000882939  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  35.74 
 
 		 625 aa  383  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  38.69 
 
 		 607 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  36.15 
 
 		 599 aa  383  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 644 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4491  excinuclease ABC subunit C  40.72 
 
 		 642 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.191027 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1334  excinuclease ABC subunit C  36.84 
 
 		 609 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000285239  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  39.06 
 
 		 629 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  39.35 
 
 		 690 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  37.91 
 
 		 609 aa  382  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  34.95 
 
 		 644 aa  382  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  40.46 
 
 		 591 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  39.07 
 
 		 691 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0690  excinuclease ABC subunit C  39.35 
 
 		 690 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.485523  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  39.53 
 
 		 609 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  38.81 
 
 		 658 aa  381  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  36.68 
 
 		 609 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  39.4 
 
 		 590 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  36.83 
 
 		 671 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  37.91 
 
 		 609 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  37.91 
 
 		 609 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  37.06 
 
 		 593 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2599  excinuclease ABC subunit C  37.25 
 
 		 609 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00115318  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1276  excinuclease ABC subunit C  36.72 
 
 		 609 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00138903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2676  excinuclease ABC subunit C  37.42 
 
 		 609 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  37.09 
 
 		 649 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0782  excinuclease ABC subunit C  39.23 
 
 		 674 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191761  normal  0.0714693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  38.41 
 
 		 653 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  37.14 
 
 		 622 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1783  excinuclease ABC subunit C  37.25 
 
 		 610 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0533171  hitchhiker  0.000000162173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  37.75 
 
 		 609 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  37.12 
 
 		 617 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  37.67 
 
 		 656 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1086  excinuclease ABC subunit C  38.38 
 
 		 680 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000501867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  35.73 
 
 		 638 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  36.2 
 
 		 627 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  37.12 
 
 		 617 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2561  excinuclease ABC subunit C  36.93 
 
 		 609 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00257936  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1391  excinuclease ABC, C subunit  37.71 
 
 		 605 aa  373  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  38.79 
 
 		 611 aa  375  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1232  excinuclease ABC subunit C  38.1 
 
 		 680 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  36.76 
 
 		 665 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  39.41 
 
 		 610 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  34.99 
 
 		 613 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0901  excinuclease ABC subunit C  37.64 
 
 		 699 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.686054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  37.79 
 
 		 608 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  37.79 
 
 		 623 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>