More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2010 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 611 aa  1213    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  47.56 
 
 		 647 aa  518  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  43.5 
 
 		 607 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  43.38 
 
 		 624 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  44.26 
 
 		 601 aa  489  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  40.89 
 
 		 685 aa  481  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  40.98 
 
 		 607 aa  472  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  40.98 
 
 		 607 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  45.85 
 
 		 613 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  40.65 
 
 		 607 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  41.82 
 
 		 588 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  41.41 
 
 		 649 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  40.94 
 
 		 656 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  39.72 
 
 		 669 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  40.51 
 
 		 641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  39.97 
 
 		 644 aa  443  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  41.69 
 
 		 653 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  38.21 
 
 		 598 aa  445  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  39.1 
 
 		 625 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 		 604 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  40.26 
 
 		 682 aa  439  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  40.22 
 
 		 665 aa  435  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  39.63 
 
 		 671 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  43.99 
 
 		 622 aa  433  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  36.73 
 
 		 620 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  36.73 
 
 		 620 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  40.09 
 
 		 666 aa  432  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  39.81 
 
 		 666 aa  428  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  41.29 
 
 		 708 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  42.67 
 
 		 614 aa  428  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  38.75 
 
 		 737 aa  424  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  41.29 
 
 		 658 aa  425  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 617 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  38.95 
 
 		 594 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  38.95 
 
 		 594 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  38.95 
 
 		 594 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  41.06 
 
 		 665 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  39.8 
 
 		 613 aa  420  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  40.76 
 
 		 660 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  38.59 
 
 		 594 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  38.95 
 
 		 594 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.51 
 
 		 613 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  38.63 
 
 		 594 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  40.4 
 
 		 675 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  38.95 
 
 		 594 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  38.63 
 
 		 594 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  40.88 
 
 		 663 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  40.88 
 
 		 678 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  40.4 
 
 		 607 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  42.07 
 
 		 690 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  40.4 
 
 		 607 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  40.47 
 
 		 646 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  39.34 
 
 		 679 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  40.34 
 
 		 641 aa  412  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  40.16 
 
 		 678 aa  412  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  38.67 
 
 		 627 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  39.35 
 
 		 676 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  38.3 
 
 		 594 aa  412  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  39.66 
 
 		 670 aa  410  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 		 607 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  39.35 
 
 		 676 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  39.83 
 
 		 608 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  39.35 
 
 		 676 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 		 590 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  38.49 
 
 		 596 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  40.95 
 
 		 612 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  39.43 
 
 		 616 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  40.37 
 
 		 684 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  39.55 
 
 		 692 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  41.84 
 
 		 616 aa  408  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  39.72 
 
 		 643 aa  407  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  40.98 
 
 		 613 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  39.83 
 
 		 608 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  39.67 
 
 		 626 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  39.9 
 
 		 607 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  37.66 
 
 		 638 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  40.03 
 
 		 585 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  41.15 
 
 		 614 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  38.88 
 
 		 705 aa  402  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13070  Excinuclease ABC subunit C  41.09 
 
 		 651 aa  404  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  38.89 
 
 		 610 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  40.16 
 
 		 611 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  40.61 
 
 		 607 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  39.67 
 
 		 609 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  38.94 
 
 		 591 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  38.66 
 
 		 693 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  39.84 
 
 		 617 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  43.87 
 
 		 615 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  39.84 
 
 		 617 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20070  Excinuclease ABC subunit C  39.36 
 
 		 703 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0431256  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  38.68 
 
 		 612 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  38.94 
 
 		 649 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  36.95 
 
 		 625 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  35.45 
 
 		 615 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  38.85 
 
 		 607 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  38.99 
 
 		 659 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  38.56 
 
 		 624 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  36.73 
 
 		 628 aa  399  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  38.18 
 
 		 669 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>