More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0365 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  64.36 
 
 		 613 aa  830    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  52.9 
 
 		 612 aa  644    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 636 aa  1298    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  67.66 
 
 		 614 aa  874    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  64.69 
 
 		 649 aa  823    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  64.52 
 
 		 623 aa  820    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  55.59 
 
 		 604 aa  656    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  60.59 
 
 		 617 aa  771    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  43.6 
 
 		 716 aa  505  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  44.41 
 
 		 677 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  43.15 
 
 		 707 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  43.15 
 
 		 707 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  43.15 
 
 		 707 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  41.41 
 
 		 607 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  40.47 
 
 		 624 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  43.19 
 
 		 613 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  41.94 
 
 		 689 aa  461  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  40.75 
 
 		 607 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  40.59 
 
 		 607 aa  450  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  39 
 
 		 588 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 607 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  40.61 
 
 		 626 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  38.33 
 
 		 625 aa  425  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  39.27 
 
 		 615 aa  422  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  39.97 
 
 		 614 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  38.25 
 
 		 641 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  38.75 
 
 		 685 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  38.34 
 
 		 653 aa  418  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  38.93 
 
 		 598 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  38.34 
 
 		 620 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  38.34 
 
 		 620 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  41.21 
 
 		 609 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  39.67 
 
 		 611 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  37.92 
 
 		 626 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  37.32 
 
 		 604 aa  404  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  37.48 
 
 		 599 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  38.07 
 
 		 617 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  36.5 
 
 		 669 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  39.8 
 
 		 636 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  38.93 
 
 		 613 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  38.55 
 
 		 599 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  38.07 
 
 		 617 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  36.32 
 
 		 610 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  40.32 
 
 		 615 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  39.46 
 
 		 607 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  40.43 
 
 		 591 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  36.83 
 
 		 613 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  36.07 
 
 		 627 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  38.83 
 
 		 611 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  36.7 
 
 		 601 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  38.18 
 
 		 608 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  34.63 
 
 		 625 aa  392  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  38.34 
 
 		 619 aa  386  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  37.62 
 
 		 623 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  37.85 
 
 		 608 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  34.93 
 
 		 613 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  40.07 
 
 		 590 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  37.62 
 
 		 613 aa  386  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  37.68 
 
 		 622 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  38.21 
 
 		 631 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  36.45 
 
 		 591 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  37.46 
 
 		 623 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  37.42 
 
 		 608 aa  385  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  36.89 
 
 		 665 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  36.85 
 
 		 631 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  37.62 
 
 		 623 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  37.42 
 
 		 623 aa  385  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  39.08 
 
 		 596 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  38.02 
 
 		 631 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  37.3 
 
 		 618 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  37.13 
 
 		 618 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  34 
 
 		 638 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  37.24 
 
 		 607 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  38.44 
 
 		 639 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  37.87 
 
 		 609 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  35.89 
 
 		 622 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1783  excinuclease ABC subunit C  37.83 
 
 		 610 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0533171  hitchhiker  0.000000162173 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2676  excinuclease ABC subunit C  37.67 
 
 		 609 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  37.94 
 
 		 609 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  36.48 
 
 		 607 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 594 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  37.44 
 
 		 708 aa  379  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  37.03 
 
 		 609 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  37.06 
 
 		 604 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2599  excinuclease ABC subunit C  37.67 
 
 		 609 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00115318  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  37.76 
 
 		 644 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  34.4 
 
 		 640 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  37.94 
 
 		 609 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  37.83 
 
 		 609 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  37.81 
 
 		 594 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  34.36 
 
 		 640 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  36.2 
 
 		 607 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 		 594 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  37.81 
 
 		 594 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2276  excinuclease ABC, C subunit  38.44 
 
 		 644 aa  375  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  37.81 
 
 		 594 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  38.37 
 
 		 614 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  35.28 
 
 		 628 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  37.25 
 
 		 619 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 607 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>