More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0328 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_08821  excinuclease ABC subunit C  59.81 
 
 		 647 aa  747    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.23805  hitchhiker  0.000233595 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09771  excinuclease ABC subunit C  60.95 
 
 		 652 aa  796    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  56.42 
 
 		 624 aa  753    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 640 aa  1304    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  98.9 
 
 		 640 aa  1289    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  54.96 
 
 		 627 aa  731    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  56.22 
 
 		 617 aa  724    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09641  excinuclease ABC subunit C  56.31 
 
 		 644 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1115  excinuclease ABC subunit C  61.22 
 
 		 679 aa  786    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.86041  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1363  excinuclease ABC subunit C  61.3 
 
 		 661 aa  790    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.205269  normal  0.348926 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0918  excinuclease ABC subunit C  60.32 
 
 		 652 aa  787    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.312337  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  56.85 
 
 		 643 aa  753    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  54.43 
 
 		 625 aa  709    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  56.22 
 
 		 617 aa  724    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  55.47 
 
 		 622 aa  737    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09791  excinuclease ABC subunit C  60.79 
 
 		 652 aa  790    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  56.94 
 
 		 638 aa  743    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14941  excinuclease ABC subunit C  59.28 
 
 		 667 aa  771    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.326891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 		 624 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  39.87 
 
 		 607 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  36.76 
 
 		 601 aa  430  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 588 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  37.22 
 
 		 685 aa  418  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  38.4 
 
 		 613 aa  406  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  36.84 
 
 		 614 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  36.18 
 
 		 604 aa  404  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  37.36 
 
 		 625 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  37.36 
 
 		 607 aa  398  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  37.1 
 
 		 619 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  38.46 
 
 		 615 aa  396  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  37.36 
 
 		 607 aa  398  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  37.4 
 
 		 615 aa  398  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  37.2 
 
 		 607 aa  395  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  36.55 
 
 		 647 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  37.03 
 
 		 689 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  36.65 
 
 		 631 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  35.05 
 
 		 649 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  34.51 
 
 		 656 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  35.38 
 
 		 671 aa  388  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  34.72 
 
 		 641 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  35.43 
 
 		 622 aa  382  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  35.32 
 
 		 653 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  35.87 
 
 		 607 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  33.92 
 
 		 708 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  36.15 
 
 		 631 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  35.3 
 
 		 646 aa  378  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  35.67 
 
 		 611 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  36.67 
 
 		 613 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  34.18 
 
 		 626 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  35.55 
 
 		 613 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  34.36 
 
 		 636 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  34.58 
 
 		 660 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  33.92 
 
 		 649 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  33.97 
 
 		 612 aa  375  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  34.88 
 
 		 663 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  34 
 
 		 693 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1086  excinuclease ABC subunit C  34.22 
 
 		 680 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000501867 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  34.62 
 
 		 628 aa  372  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  35.19 
 
 		 614 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13070  Excinuclease ABC subunit C  35.02 
 
 		 651 aa  372  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  34.96 
 
 		 610 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20070  Excinuclease ABC subunit C  33.74 
 
 		 703 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0431256  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  34.06 
 
 		 644 aa  370  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  33.75 
 
 		 641 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  34.5 
 
 		 666 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  33.59 
 
 		 675 aa  372  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1232  excinuclease ABC subunit C  34.32 
 
 		 680 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  34.9 
 
 		 679 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  33.23 
 
 		 670 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1558  excinuclease ABC subunit C  34.74 
 
 		 690 aa  369  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  34 
 
 		 665 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  35.18 
 
 		 613 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  33.78 
 
 		 707 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2550  excinuclease ABC, C subunit  35.51 
 
 		 675 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  35.35 
 
 		 677 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  35.87 
 
 		 627 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 613 aa  365  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  33.78 
 
 		 707 aa  364  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  32.87 
 
 		 674 aa  363  4e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  35.53 
 
 		 616 aa  363  4e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  33.86 
 
 		 658 aa  363  5.0000000000000005e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  33.18 
 
 		 665 aa  363  7.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  33.33 
 
 		 669 aa  362  8e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1362  excinuclease ABC subunit C  33.23 
 
 		 704 aa  362  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  33.86 
 
 		 613 aa  361  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  33.78 
 
 		 707 aa  362  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  34.45 
 
 		 659 aa  361  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  34.17 
 
 		 678 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  35.12 
 
 		 629 aa  361  3e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  34.87 
 
 		 653 aa  360  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  36.01 
 
 		 628 aa  359  8e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  33.69 
 
 		 676 aa  359  8e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  33.69 
 
 		 676 aa  359  8e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  33.69 
 
 		 676 aa  359  9e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  35.14 
 
 		 598 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  33.81 
 
 		 691 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 643 aa  359  9.999999999999999e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1997  excinuclease ABC subunit C  33.75 
 
 		 644 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.657306 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  34.6 
 
 		 623 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  33.18 
 
 		 688 aa  357  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>