More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1363 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_09771  excinuclease ABC subunit C  58.25 
 
 		 652 aa  818    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  61.3 
 
 		 640 aa  835    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14941  excinuclease ABC subunit C  77.79 
 
 		 667 aa  997    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.326891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  58.91 
 
 		 638 aa  791    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  60.34 
 
 		 627 aa  794    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09641  excinuclease ABC subunit C  53.8 
 
 		 644 aa  752    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1115  excinuclease ABC subunit C  89.7 
 
 		 679 aa  1155    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.86041  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1363  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 661 aa  1347    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.205269  normal  0.348926 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0918  excinuclease ABC subunit C  57.94 
 
 		 652 aa  812    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.312337  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  66.15 
 
 		 643 aa  860    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08821  excinuclease ABC subunit C  61.01 
 
 		 647 aa  780    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.23805  hitchhiker  0.000233595 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  57.99 
 
 		 625 aa  759    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  60.13 
 
 		 622 aa  802    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  61.39 
 
 		 640 aa  838    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09791  excinuclease ABC subunit C  58.25 
 
 		 652 aa  814    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  62.71 
 
 		 624 aa  820    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  60.92 
 
 		 617 aa  775    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  60.92 
 
 		 617 aa  775    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  38.35 
 
 		 607 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  37.57 
 
 		 685 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  38.56 
 
 		 624 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  38.35 
 
 		 607 aa  430  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  38.51 
 
 		 607 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  38.49 
 
 		 604 aa  428  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  36.74 
 
 		 625 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  36.09 
 
 		 601 aa  414  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  37.88 
 
 		 607 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  38.68 
 
 		 588 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  39.03 
 
 		 613 aa  409  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  39.07 
 
 		 614 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  40.35 
 
 		 615 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  36.6 
 
 		 708 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  35.79 
 
 		 641 aa  385  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  35.44 
 
 		 598 aa  385  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  36.18 
 
 		 619 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  37.38 
 
 		 631 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  33.91 
 
 		 620 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  33.91 
 
 		 620 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  37 
 
 		 671 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  34.11 
 
 		 615 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  35.85 
 
 		 613 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13070  Excinuclease ABC subunit C  36.57 
 
 		 651 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  33.59 
 
 		 613 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  32.99 
 
 		 644 aa  372  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  33.81 
 
 		 613 aa  375  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  36.89 
 
 		 675 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  36.58 
 
 		 622 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  37.62 
 
 		 611 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  36.88 
 
 		 700 aa  372  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  35.83 
 
 		 635 aa  372  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  36.57 
 
 		 607 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  36.57 
 
 		 670 aa  368  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  36.25 
 
 		 674 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  35.2 
 
 		 677 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  35.56 
 
 		 617 aa  369  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  34.1 
 
 		 631 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1362  excinuclease ABC subunit C  35.04 
 
 		 704 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  36.18 
 
 		 646 aa  365  1e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  37.32 
 
 		 649 aa  365  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  36.16 
 
 		 643 aa  365  1e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  36.03 
 
 		 656 aa  365  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  34.58 
 
 		 665 aa  365  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  36.04 
 
 		 614 aa  365  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  35.27 
 
 		 653 aa  364  3e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  35.03 
 
 		 690 aa  364  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  34.67 
 
 		 669 aa  363  6e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0690  excinuclease ABC subunit C  35.03 
 
 		 690 aa  363  6e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.485523  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  35.66 
 
 		 682 aa  362  8e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  37.4 
 
 		 591 aa  362  9e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  34.57 
 
 		 628 aa  362  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  36.84 
 
 		 678 aa  362  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  35.5 
 
 		 682 aa  360  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  34.41 
 
 		 691 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  36.94 
 
 		 665 aa  360  4e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  36.61 
 
 		 644 aa  360  4e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  35.71 
 
 		 647 aa  360  4e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  35.36 
 
 		 688 aa  360  5e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  36.58 
 
 		 604 aa  360  7e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  35.11 
 
 		 628 aa  359  8e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  33.89 
 
 		 636 aa  359  8e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  36.96 
 
 		 678 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  35.63 
 
 		 707 aa  359  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  36.76 
 
 		 660 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  35.97 
 
 		 623 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  35.49 
 
 		 629 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2550  excinuclease ABC, C subunit  36.39 
 
 		 675 aa  358  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295738  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  35.83 
 
 		 641 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  35.36 
 
 		 631 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  34.67 
 
 		 653 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1281  excinuclease ABC subunit C  35.56 
 
 		 695 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280524  normal  0.136737 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  35.8 
 
 		 613 aa  357  5e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0772  excinuclease ABC subunit C  34.2 
 
 		 633 aa  357  5e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00962744  normal  0.347624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  35.45 
 
 		 658 aa  356  5.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  36.59 
 
 		 658 aa  356  5.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  35.82 
 
 		 623 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  36.95 
 
 		 650 aa  356  8.999999999999999e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  35.61 
 
 		 663 aa  356  8.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1177  excinuclease ABC subunit C  35.56 
 
 		 695 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.8668  normal  0.100977 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  35.78 
 
 		 707 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1558  excinuclease ABC subunit C  34.46 
 
 		 690 aa  355  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>