More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1254 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 615 aa  1238    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  51.14 
 
 		 619 aa  595  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  52 
 
 		 627 aa  590  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  51.65 
 
 		 631 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  49.68 
 
 		 628 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  49.6 
 
 		 629 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  50.33 
 
 		 616 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  49.03 
 
 		 628 aa  555  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  42.95 
 
 		 596 aa  508  9.999999999999999e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  43.74 
 
 		 596 aa  503  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  45.21 
 
 		 624 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  42.76 
 
 		 598 aa  493  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  43.55 
 
 		 607 aa  490  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  41.72 
 
 		 597 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  45.36 
 
 		 613 aa  475  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  40.07 
 
 		 602 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  43.31 
 
 		 588 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  39.28 
 
 		 603 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  41.29 
 
 		 599 aa  455  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  42.05 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  40.7 
 
 		 625 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  42.49 
 
 		 617 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  42.49 
 
 		 617 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 		 613 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  43.09 
 
 		 624 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  39.68 
 
 		 615 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  38.81 
 
 		 596 aa  452  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  42.52 
 
 		 601 aa  451  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  39.9 
 
 		 620 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  39.9 
 
 		 620 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  41.32 
 
 		 627 aa  445  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  38.31 
 
 		 598 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  45.23 
 
 		 607 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  40.62 
 
 		 604 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  41.24 
 
 		 685 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  41.15 
 
 		 638 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  43.39 
 
 		 590 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  44.02 
 
 		 614 aa  438  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  38.23 
 
 		 615 aa  435  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  40.79 
 
 		 641 aa  435  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  41 
 
 		 613 aa  430  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  43.21 
 
 		 591 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  40.74 
 
 		 622 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  41.43 
 
 		 653 aa  429  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  40.19 
 
 		 625 aa  428  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  45.24 
 
 		 610 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  40.62 
 
 		 613 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  40.22 
 
 		 628 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  40.33 
 
 		 607 aa  424  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  41.13 
 
 		 594 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  41.13 
 
 		 594 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  38.62 
 
 		 640 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  41.13 
 
 		 594 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  42.79 
 
 		 613 aa  422  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  41.87 
 
 		 647 aa  425  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  40.33 
 
 		 607 aa  425  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 640 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  41.13 
 
 		 594 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  41.13 
 
 		 594 aa  420  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  41.29 
 
 		 594 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  41.13 
 
 		 594 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  41.07 
 
 		 596 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  43.42 
 
 		 609 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  43.87 
 
 		 611 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  41.46 
 
 		 611 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  41.13 
 
 		 594 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  40.59 
 
 		 643 aa  418  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  38.9 
 
 		 598 aa  418  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  40.65 
 
 		 594 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  41.13 
 
 		 594 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  43.65 
 
 		 622 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 593 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  41.69 
 
 		 656 aa  413  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  39.71 
 
 		 599 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  40.32 
 
 		 636 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  39.67 
 
 		 599 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  39.21 
 
 		 607 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0859  hypothetical protein  37.33 
 
 		 598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  42.74 
 
 		 613 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  40.32 
 
 		 623 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1363  excinuclease ABC subunit C  40.5 
 
 		 661 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.205269  normal  0.348926 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  40.48 
 
 		 623 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09771  excinuclease ABC subunit C  37.46 
 
 		 652 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  42.23 
 
 		 603 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  41.52 
 
 		 614 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  41.05 
 
 		 623 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  39.45 
 
 		 669 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09641  excinuclease ABC subunit C  37.4 
 
 		 644 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  39.63 
 
 		 671 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  37.52 
 
 		 652 aa  397  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  39.32 
 
 		 593 aa  395  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  40.19 
 
 		 649 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0918  excinuclease ABC subunit C  37.46 
 
 		 652 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.312337  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  41.09 
 
 		 607 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  41.57 
 
 		 604 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09791  excinuclease ABC subunit C  37.3 
 
 		 652 aa  399  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14941  excinuclease ABC subunit C  39.56 
 
 		 667 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.326891 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  40.54 
 
 		 604 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  38.04 
 
 		 595 aa  393  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  40.87 
 
 		 666 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>