More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1772 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  64.84 
 
 
619 aa  827    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  62 
 
 
628 aa  778    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  64.97 
 
 
629 aa  816    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  64.64 
 
 
627 aa  824    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  70.16 
 
 
616 aa  885    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
628 aa  1295    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  65.84 
 
 
631 aa  828    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  49.35 
 
 
615 aa  556  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  41.94 
 
 
607 aa  472  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  40.13 
 
 
596 aa  468  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 
624 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  41.16 
 
 
596 aa  455  1.0000000000000001e-126  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  38.78 
 
 
602 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  39.66 
 
 
598 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  39.75 
 
 
620 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  39.59 
 
 
620 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  38.83 
 
 
598 aa  442  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  38.63 
 
 
603 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  38.69 
 
 
597 aa  439  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  40.17 
 
 
613 aa  433  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  40.59 
 
 
599 aa  430  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  39.8 
 
 
588 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  40.2 
 
 
607 aa  424  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  39.94 
 
 
607 aa  425  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  39.3 
 
 
604 aa  423  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  38.96 
 
 
601 aa  421  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  40.03 
 
 
607 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  39.94 
 
 
622 aa  418  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  39.05 
 
 
614 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  40.92 
 
 
591 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  38.25 
 
 
616 aa  418  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  38.22 
 
 
596 aa  416  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  37 
 
 
615 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  38.31 
 
 
615 aa  415  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  39.35 
 
 
610 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  38.83 
 
 
594 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  39.26 
 
 
594 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  39.1 
 
 
594 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  39.1 
 
 
594 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  39.1 
 
 
594 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  39.1 
 
 
594 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  39.1 
 
 
594 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  40.27 
 
 
610 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  39.55 
 
 
596 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  39.26 
 
 
594 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  37.69 
 
 
594 aa  402  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  38.35 
 
 
594 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  38.67 
 
 
594 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  37.93 
 
 
653 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  38.19 
 
 
685 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  37.4 
 
 
626 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  37.08 
 
 
638 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  36.13 
 
 
625 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  39.14 
 
 
613 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  38.1 
 
 
666 aa  402  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  37.75 
 
 
593 aa  399  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 
656 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  35.98 
 
 
628 aa  398  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  39.75 
 
 
612 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  38.91 
 
 
613 aa  398  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  37.83 
 
 
641 aa  399  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  37.92 
 
 
669 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  35.63 
 
 
671 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  37.48 
 
 
624 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  37.08 
 
 
617 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  38.63 
 
 
590 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  37.08 
 
 
617 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  36.05 
 
 
707 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  36.35 
 
 
692 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  36.11 
 
 
611 aa  392  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  37.15 
 
 
647 aa  392  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 
658 aa  391  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  38.73 
 
 
593 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  38.11 
 
 
599 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  38.81 
 
 
613 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  35.76 
 
 
707 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  37.19 
 
 
595 aa  388  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 
641 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  39.33 
 
 
594 aa  388  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  37.38 
 
 
603 aa  385  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  39.01 
 
 
614 aa  385  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  36.29 
 
 
604 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  36.57 
 
 
644 aa  384  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  35.93 
 
 
658 aa  383  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  35.76 
 
 
707 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  38.85 
 
 
613 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  37.91 
 
 
594 aa  381  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  38.56 
 
 
618 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  36.22 
 
 
649 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  38.01 
 
 
666 aa  380  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  35.84 
 
 
598 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  36.33 
 
 
599 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  38.55 
 
 
591 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  36.79 
 
 
607 aa  382  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  36.34 
 
 
674 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  38.2 
 
 
652 aa  378  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  38.24 
 
 
618 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  37.34 
 
 
737 aa  376  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  35.25 
 
 
613 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  37.29 
 
 
609 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>