More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2478 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 652 aa  1337    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  38.87 
 
 		 607 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  38.15 
 
 		 624 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  36.97 
 
 		 607 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  36.46 
 
 		 607 aa  397  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  36.51 
 
 		 607 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0464  excinuclease ABC subunit C  36.46 
 
 		 603 aa  387  1e-106  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.646786  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  37.37 
 
 		 615 aa  378  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  37.88 
 
 		 619 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.2 
 
 		 628 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  37.3 
 
 		 591 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  34.99 
 
 		 641 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  36.92 
 
 		 590 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  37.2 
 
 		 594 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  37.36 
 
 		 594 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  37.04 
 
 		 594 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  37.2 
 
 		 594 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  37.2 
 
 		 594 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  37.2 
 
 		 594 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  37.04 
 
 		 594 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  34 
 
 		 601 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  37.91 
 
 		 612 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  36.77 
 
 		 588 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  36.41 
 
 		 594 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  36.04 
 
 		 613 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  37.04 
 
 		 594 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  36.22 
 
 		 604 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  37.04 
 
 		 594 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  37.36 
 
 		 631 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  36.45 
 
 		 596 aa  365  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  38.37 
 
 		 520 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  34.32 
 
 		 653 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  35.52 
 
 		 658 aa  363  6e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  36.32 
 
 		 613 aa  363  8e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  34.82 
 
 		 610 aa  360  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  35.13 
 
 		 598 aa  359  8e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  35.96 
 
 		 613 aa  359  9.999999999999999e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  37.09 
 
 		 628 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  37.3 
 
 		 616 aa  357  5e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  35.27 
 
 		 594 aa  355  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  33.94 
 
 		 625 aa  355  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  33.44 
 
 		 611 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  37.28 
 
 		 627 aa  353  4e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  35.8 
 
 		 593 aa  353  5e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  33.47 
 
 		 685 aa  353  5.9999999999999994e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  34.46 
 
 		 620 aa  353  5.9999999999999994e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  37.24 
 
 		 517 aa  352  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  35.77 
 
 		 622 aa  352  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  34.31 
 
 		 620 aa  352  2e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  37.7 
 
 		 521 aa  350  5e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  33.69 
 
 		 614 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  33.76 
 
 		 594 aa  348  2e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  35.34 
 
 		 593 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  35.34 
 
 		 593 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  33.54 
 
 		 595 aa  348  2e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  33.64 
 
 		 616 aa  347  4e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  33.84 
 
 		 636 aa  346  7e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  35.51 
 
 		 604 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  36.63 
 
 		 519 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  37.15 
 
 		 520 aa  343  5e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  33.54 
 
 		 677 aa  342  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  35.01 
 
 		 599 aa  340  5.9999999999999996e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  36.74 
 
 		 526 aa  340  7e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  34.62 
 
 		 626 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  33.28 
 
 		 591 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  33.99 
 
 		 615 aa  335  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  36.57 
 
 		 527 aa  335  2e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  32.56 
 
 		 665 aa  334  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  33.91 
 
 		 598 aa  334  3e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  33.59 
 
 		 628 aa  333  5e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  35.28 
 
 		 623 aa  333  8e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  34.15 
 
 		 613 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  33.03 
 
 		 617 aa  332  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  35.22 
 
 		 649 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  36.57 
 
 		 527 aa  330  6e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  34.32 
 
 		 689 aa  330  7e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  33.07 
 
 		 615 aa  329  8e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  31.95 
 
 		 613 aa  329  8e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  35.07 
 
 		 527 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  31.61 
 
 		 638 aa  327  6e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  33.13 
 
 		 636 aa  327  6e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  33.03 
 
 		 597 aa  326  8.000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  33.76 
 
 		 598 aa  326  9e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  33.23 
 
 		 599 aa  325  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  32.66 
 
 		 669 aa  325  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  33.75 
 
 		 594 aa  325  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  31.88 
 
 		 647 aa  324  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  34.52 
 
 		 612 aa  324  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  32.71 
 
 		 593 aa  324  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  34.73 
 
 		 516 aa  324  4e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  33.07 
 
 		 607 aa  324  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  32.32 
 
 		 625 aa  323  5e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  33.7 
 
 		 611 aa  323  5e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  34.69 
 
 		 607 aa  322  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  32.81 
 
 		 599 aa  322  1.9999999999999998e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  30.9 
 
 		 671 aa  320  5e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  31.66 
 
 		 649 aa  320  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  33.23 
 
 		 604 aa  320  7e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 707 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0659  excinuclease ABC subunit C  34.47 
 
 		 557 aa  319  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>