More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1485 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
598 aa  1206    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  43.47 
 
 
607 aa  495  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  40.68 
 
 
624 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  39.57 
 
 
614 aa  456  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  40.53 
 
 
607 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  42.18 
 
 
622 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  40.53 
 
 
607 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  40.39 
 
 
607 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  40.53 
 
 
612 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  40.49 
 
 
613 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  38.21 
 
 
611 aa  445  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 
588 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 
625 aa  438  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  40.06 
 
 
620 aa  432  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  38.13 
 
 
685 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  39.74 
 
 
620 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  38.47 
 
 
604 aa  424  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  40.16 
 
 
615 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  37.86 
 
 
613 aa  422  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  40.23 
 
 
622 aa  419  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  38.55 
 
 
677 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  37.17 
 
 
638 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  39.77 
 
 
601 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  38.8 
 
 
627 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  38.66 
 
 
617 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  38.66 
 
 
617 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  38.93 
 
 
636 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 
625 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  38.22 
 
 
641 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  38.95 
 
 
611 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  39.01 
 
 
613 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  38.54 
 
 
613 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  38.27 
 
 
613 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  36.64 
 
 
628 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  37.66 
 
 
624 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  37.75 
 
 
614 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  38.21 
 
 
617 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  35.81 
 
 
647 aa  401  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  36.87 
 
 
604 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  35.57 
 
 
707 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  38.57 
 
 
615 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  35.27 
 
 
707 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  35.42 
 
 
707 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  34.56 
 
 
669 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  32.81 
 
 
671 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  37.07 
 
 
623 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  37.36 
 
 
649 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  38.34 
 
 
609 aa  392  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 
619 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  35.29 
 
 
708 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  36.75 
 
 
653 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  34.08 
 
 
649 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  36.68 
 
 
607 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  39.66 
 
 
517 aa  387  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  37.78 
 
 
643 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  34.76 
 
 
665 aa  386  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  37.02 
 
 
617 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  34.76 
 
 
656 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  35.44 
 
 
716 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  35.82 
 
 
613 aa  381  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  33.98 
 
 
644 aa  379  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 
666 aa  382  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1334  excinuclease ABC subunit C  37.66 
 
 
609 aa  379  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000285239  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  35.96 
 
 
690 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1276  excinuclease ABC subunit C  37.66 
 
 
609 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00138903  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  37.46 
 
 
608 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  37.69 
 
 
599 aa  375  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  35.36 
 
 
610 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  33.96 
 
 
641 aa  375  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  37.29 
 
 
608 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  33.02 
 
 
658 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  36.35 
 
 
613 aa  370  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  32.73 
 
 
692 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  37.58 
 
 
628 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  37.71 
 
 
619 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  35.61 
 
 
626 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  34.36 
 
 
737 aa  368  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  37.13 
 
 
636 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1115  excinuclease ABC subunit C  34.69 
 
 
679 aa  368  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.86041  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1363  excinuclease ABC subunit C  34.97 
 
 
661 aa  366  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.205269  normal  0.348926 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  37.27 
 
 
593 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  35.68 
 
 
658 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0901  excinuclease ABC subunit C  36.29 
 
 
699 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.686054  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  36.82 
 
 
616 aa  368  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  36.38 
 
 
616 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  33.91 
 
 
676 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  33.01 
 
 
646 aa  368  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  33.91 
 
 
676 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1728  excinuclease ABC subunit C  36.42 
 
 
688 aa  369  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0415792 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  33.91 
 
 
676 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  32.72 
 
 
665 aa  369  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  35.15 
 
 
626 aa  365  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  34.97 
 
 
663 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  32.07 
 
 
679 aa  363  3e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  37.1 
 
 
607 aa  364  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  36.7 
 
 
610 aa  364  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  32.4 
 
 
705 aa  362  8e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  33.98 
 
 
649 aa  362  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14941  excinuclease ABC subunit C  34.39 
 
 
667 aa  362  9e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.326891 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  35.85 
 
 
629 aa  362  9e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>